Renaming in PME-routines
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1 RA5     10
2 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
3 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
4 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
5 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
6 1       1       H8      C8      N9      N7      
7 2       3       H6      N6      C6      C5      
8 1       1       H2      C2      N1      N3      
9 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
10 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
11 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
12 RA      9
13 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
14 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
15 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
16 1       1       H8      C8      N9      N7      
17 2       3       H6      N6      C6      C5      
18 1       1       H2      C2      N1      N3      
19 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
20 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
21 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
22 RA3     10
23 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
24 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
25 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
26 1       1       H8      C8      N9      N7      
27 2       3       H6      N6      C6      C5      
28 1       1       H2      C2      N1      N3      
29 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
30 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
31 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
32 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
33 RAN     11
34 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
35 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
36 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
37 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
38 1       1       H8      C8      N9      N7      
39 2       3       H6      N6      C6      C5      
40 1       1       H2      C2      N1      N3      
41 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
42 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
43 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
44 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
45 DT5     9
46 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
47 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
48 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
49 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
50 1       1       H6      C6      N1      C5      
51 3       4       H7      C7      C5      C6      
52 1       1       H3      N3      C4      C2      
53 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
54 2       6       H2'     C2'     C1'     C3'     
55 DT      8
56 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
57 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
58 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
59 1       1       H6      C6      N1      C5      
60 3       4       H7      C7      C5      C6      
61 1       1       H3      N3      C4      C2      
62 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
63 2       6       H2'     C2'     C1'     C3'     
64 DT3     9
65 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
66 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
67 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
68 1       1       H6      C6      N1      C5      
69 3       4       H7      C7      C5      C6      
70 1       1       H3      N3      C4      C2      
71 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
72 2       6       H2'     C2'     C1'     C3'     
73 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
74 RU5     10
75 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
76 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
77 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
78 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
79 1       1       H6      C6      N1      C5      
80 1       1       H5      C5      C6      C4      
81 1       1       H3      N3      C4      C2      
82 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
83 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
84 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
85 RU      9
86 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
87 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
88 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
89 1       1       H6      C6      N1      C5      
90 1       1       H5      C5      C6      C4      
91 1       1       H3      N3      C4      C2      
92 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
93 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
94 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
95 RU3     10
96 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
97 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
98 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
99 1       1       H6      C6      N1      C5      
100 1       1       H5      C5      C6      C4      
101 1       1       H3      N3      C4      C2      
102 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
103 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
104 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
105 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
106 RUN     11
107 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
108 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
109 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
110 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
111 1       1       H6      C6      N1      C5      
112 1       1       H5      C5      C6      C4      
113 1       1       H3      N3      C4      C2      
114 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
115 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
116 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
117 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
118 RG5     10
119 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
120 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
121 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
122 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
123 1       1       H8      C8      N9      N7      
124 1       1       H1      N1      C6      C2      
125 2       3       H2      N2      C2      N1      
126 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
127 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
128 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
129 RG      9
130 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
131 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
132 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
133 1       1       H8      C8      N9      N7      
134 1       1       H1      N1      C6      C2      
135 2       3       H2      N2      C2      N1      
136 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
137 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
138 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
139 RG3     10
140 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
141 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
142 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
143 1       1       H8      C8      N9      N7      
144 1       1       H1      N1      C6      C2      
145 2       3       H2      N2      C2      N1      
146 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
147 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
148 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
149 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
150 RGN     11
151 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
152 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
153 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
154 1       5       H1'     C1'     O4'     N9      C2'     
155 1       1       H8      C8      N9      N7      
156 1       1       H1      N1      C6      C2      
157 2       3       H2      N2      C2      N1      
158 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
159 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
160 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
161 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
162 RC5     10
163 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
164 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
165 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
166 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
167 1       1       H6      C6      N1      C5      
168 1       1       H5      C5      C6      C4      
169 2       3       H4      N4      C4      C5      
170 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
171 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
172 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
173 RC      9
174 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
175 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
176 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
177 1       1       H6      C6      N1      C5      
178 1       1       H5      C5      C6      C4      
179 2       3       H4      N4      C4      C5      
180 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
181 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
182 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
183 RC3     10
184 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
185 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
186 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
187 1       1       H6      C6      N1      C5      
188 1       1       H5      C5      C6      C4      
189 2       3       H4      N4      C4      C5      
190 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
191 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
192 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
193 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'     
194 RCN     11
195 1       2       H5T     O5'     C5'     C4'     
196 2       6       H5'     C5'     O5'     C4'     
197 1       5       H4'     C4'     C5'     O4'     C3'     
198 1       5       H1'     C1'     O4'     N1      C2'     
199 1       1       H6      C6      N1      C5      
200 1       1       H5      C5      C6      C4      
201 2       3       H4      N4      C4      C5      
202 1       5       H3'     C3'     C4'     C2'     O3'     
203 1       5       H2'1    C2'     C1'     C3'     O2'     
204 1       2       HO'2    O2'     C2'     C1'     
205 1       2       H3T     O3'     C3'     C4'