share/top/amber03.ff/ffnonbonded.itp

   1 [ atomtypes ]
   2 ; name      at.num  mass     charge ptype  sigma      epsilon
   3 H0           1       1.008   0.0000  A   2.47135e-01  6.56888e-02
   4 Br          35      79.90    0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
   5 C            6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
   6 CA           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
   7 CB           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
   8 CC           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
   9 CK           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  10 CM           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  11 CN           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  12 CQ           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  13 CR           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  14 CT           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  4.57730e-01
  15 CV           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  16 CW           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  17 C*           6      12.01    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  18 C0          20      40.08    0.0000  A   3.05240e-01  1.92376e+00
  19 F            9      19.00    0.0000  A   3.11815e-01  2.55224e-01
  20 H            1       1.008   0.0000  A   1.06908e-01  6.56888e-02
  21 HC           1       1.008   0.0000  A   2.64953e-01  6.56888e-02
  22 H1           1       1.008   0.0000  A   2.47135e-01  6.56888e-02
  23 H2           1       1.008   0.0000  A   2.29317e-01  6.56888e-02
  24 H3           1       1.008   0.0000  A   2.11499e-01  6.56888e-02
  25 HA           1       1.008   0.0000  A   2.59964e-01  6.27600e-02
  26 H4           1       1.008   0.0000  A   2.51055e-01  6.27600e-02
  27 H5           1       1.008   0.0000  A   2.42146e-01  6.27600e-02
  28 HO           1       1.008   0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  29 HS           1       1.008   0.0000  A   1.06908e-01  6.56888e-02
  30 HW           1       1.008   0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  31 HP           1       1.008   0.0000  A   1.95998e-01  6.56888e-02
  32 I           53     126.9     0.0000  A   4.18722e-01  1.67360e+00
  33 Cl          17      35.45    0.0000  A   4.40104e-01  4.18400e-01
  34 Na          11      22.99    0.0000  A   3.32840e-01  1.15897e-02
  35 IB           0     131.0     0.0000  A   8.90899e-01  4.18400e-01
  36 MG          12      24.305   0.0000  A   1.41225e-01  3.74342e+00
  37 N            7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  38 NA           7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  39 NB           7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  40 NC           7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  41 N2           7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  42 N3           7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  43 N*           7      14.01    0.0000  A   3.25000e-01  7.11280e-01
  44 O            8      16.00    0.0000  A   2.95992e-01  8.78640e-01
  45 OW           8      16.00    0.0000  A   3.15061e-01  6.36386e-01
  46 OH           8      16.00    0.0000  A   3.06647e-01  8.80314e-01
  47 OS           8      16.00    0.0000  A   3.00001e-01  7.11280e-01
  48 O2           8      16.00    0.0000  A   2.95992e-01  8.78640e-01
  49 P           15      30.97    0.0000  A   3.74177e-01  8.36800e-01
  50 S           16      32.06    0.0000  A   3.56359e-01  1.04600e+00
  51 SH          16      32.06    0.0000  A   3.56359e-01  1.04600e+00
  52 CU          29      63.55    0.0000  A   3.39967e-01  3.59824e-01
  53 FE          26      55.00    0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  54 K           19      39.10    0.0000  A   4.73602e-01  1.37235e-03
  55 Rb          37      85.47    0.0000  A   5.26699e-01  7.11280e-04
  56 Cs          55     132.91    0.0000  A   6.04920e-01  3.37230e-04
  57 ; spc water - use only with spc.itp & settles
  58 OW_spc       8      15.9994  0.0000  A   3.16557e-01  6.50629e-01
  59 HW_spc       1       1.0080  0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  60 Li           3       6.94    0.0000  A   2.02590e-01  7.65672e-02
  61 Zn          30      65.4     0.0000  A   1.95998e-01  5.23000e-02
  62 ;tip4p-EW
  63 HW_tip4pew   1       1.008   0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  64 OW_tip4pew   8      16.00    0.0000  A   3.16435e-01  6.80946e-01
  65 ; tip4p
  66 HW_tip4p     1       1.008   0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  67 OW_tip4p     8      16.00    0.0000  A   3.15365e-01  6.48520e-01
  68 ;tip5p
  69 HW_tip5p     1       1.008   0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  70 OW_tip5p     8      16.00    0.0000  A   3.12000e-01  6.69440e-01
  71 ; dummy defs
  72 ; MW=Dummy mass for tip4p/EW/5p water extra point charge
  73 MW           0       0.0000  0.0000  D   0.00000e+00  0.00000e+00
  74 ; Dummy masses for rigid CH3 and NH3 groups
  75 MCH3         0       0.0000  0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00
  76 MNH3         0       0.0000  0.0000  A   0.00000e+00  0.00000e+00