python_packaging/test/pytesthelpers.py

   1 #
   2 # This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3 #
   4 # Copyright (c) 2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   5 # Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6 # and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7 # top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8 #
   9 # GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10 # modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11 # as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12 # of the License, or (at your option) any later version.
  13 #
  14 # GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17 # Lesser General Public License for more details.
  18 #
  19 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20 # License along with GROMACS; if not, see
  21 # http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22 # Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23 #
  24 # If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25 # consider that scientific software is very special. Version
  26 # control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27 # consider code for inclusion in the official distribution, but
  28 # derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29 # in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30 # official version at http://www.gromacs.org.
  31 #
  32 # To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33 # the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34
  35 """Reusable definitions for test modules.
  36
  37 Define the ``withmpi_only`` test decorator.
  38 """
  39
  40 import pytest
  41
  42 # TODO: (#3718) Normalize the handling of run-time arguments.
  43 from gmxapi.simulation.mdrun import ResourceManager as _ResourceManager
  44 _ResourceManager.mdrun_kwargs = {'threads': 2}
  45
  46 withmpi_only = None
  47
  48 try:
  49     from mpi4py import MPI
  50     withmpi_only = \
  51         pytest.mark.skipif(not MPI.Is_initialized() or MPI.COMM_WORLD.Get_size() < 2,
  52                            reason="Test requires at least 2 MPI ranks, "
  53                                   + "but MPI is not initialized or context is too small.")
  54 except ImportError:
  55     withmpi_only = pytest.mark.skip(reason="Test requires at least 2 MPI ranks, but mpi4py is not available.")