python_packaging/docker/gromacs.dockerfile

   1 # Provide an easy-to-reproduce environment in which to test full Python functionality.
   2 # Produce an image with GROMACS installed. Use the root of the repository as the build context
   3
   4 # Optionally, set `--build-arg DOCKER_CORES=N` for a Docker engine running with access to more than 1 CPU.
   5 #    REF=`git show -s --pretty=format:"%h"`
   6 #    docker build -t gmxapi/gromacs-${MPIFLAVOR}:${REF} \
   7 #               --build-arg DOCKER_CORES=4 \
   8 #               --build-arg MPIFLAVOR=${MPIFLAVOR} \
   9 #               -f gromacs.dockerfile ../..
  10
  11 # This image serves as a base for integration with the gmxapi Python tools and sample code.
  12
  13 ARG MPIFLAVOR=mpich
  14 ARG REF=latest
  15 FROM gmxapi/gromacs-dependencies-$MPIFLAVOR:$REF
  16
  17 ENV SRC_DIR /tmp/gromacs-source
  18 COPY . $SRC_DIR
  19
  20 ENV BUILD_DIR /tmp/gromacs-build
  21 RUN mkdir -p $BUILD_DIR
  22 WORKDIR $BUILD_DIR
  23
  24 ARG DOCKER_CORES=1
  25 # Allow the build type to be specified with `docker build --build-arg TYPE=something`
  26 ARG TYPE=Release
  27 RUN cmake $SRC_DIR \
  28         -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/gromacs \
  29         -DGMXAPI=ON \
  30         -DGMX_THREAD_MPI=ON \
  31         -DGMX_BUILD_HELP=OFF \
  32         -DGMX_USE_RDTSCP=OFF \
  33         -DGMX_REQUIRE_VALID_TOOLCHAIN=TRUE \
  34         -DCMAKE_BUILD_TYPE=$TYPE
  35 RUN make -j$DOCKER_CORES
  36 RUN make -j$DOCKER_CORES tests
  37 RUN make -j$DOCKER_CORES install
  38
  39 # Default command provided for convenience since it inherits WORKDIR from above.
  40 CMD make check