include/types/nsborder.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *       This source code is part of
   5  *
   6  *        G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  * GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *               VERSION 2.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-1999
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * Please refer to:
  17  * GROMACS: A message-passing parallel molecular dynamics implementation
  18  * H.J.C. Berendsen, D. van der Spoel and R. van Drunen
  19  * Comp. Phys. Comm. 91, 43-56 (1995)
  20  *
  21  * Also check out our WWW page:
  22  * http://md.chem.rug.nl/~gmx
  23  * or e-mail to:
  24  * gromacs@chem.rug.nl
  25  *
  26  * And Hey:
  27  * Green Red Orange Magenta Azure Cyan Skyblue
  28  */
  29
  30 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  31 #include <config.h>
  32 #endif
  33
  34 typedef struct {
  35   int  nodeid;                  /* Node id                              */
  36   int  nnodes;                  /* The number of nodes                  */
  37   int  cgtotal;                 /* Total number of charge groups        */
  38   int  natoms;                  /* Total number of atoms                */
  39   int  nstDlb;                  /* Every how many steps must we do load */
  40                                 /* balancing                            */
  41   int  shift,bshift;            /* Coordinates are shifted left for     */
  42                                 /* 'shift' systolic pulses, and right   */
  43                                 /* for 'bshift' pulses. Forces are      */
  44                                 /* shifted right for 'shift' pulses     */
  45                                 /* and left for 'bshift' pulses         */
  46                                 /* This way is not necessary to shift   */
  47                                 /* the coordinates over the entire ring */
  48   int  homenr[MAXNODES];        /* The number of home particles         */
  49   int  index[MAXNODES];         /* The starting of the home atoms       */
  50   int  cgload[MAXNODES];        /* Division of charge groups over CPUS  */
  51                                 /* This is static, i.e. it does not     */
  52                                 /* change during the simulation         */
  53   int  workload[MAXNODES];      /* This is the load for neighbor-       */
  54                                 /* searching, this is initially the same*/
  55                                 /* as cgload, but may change due to     */
  56                                 /* dynamic load balancing               */
  57 } t_nsborder;
  58
  59 #define START(nsb)  ((nsb)->index[(nsb)->nodeid])
  60 #define HOMENR(nsb) ((nsb)->homenr[(nsb)->nodeid])
  61 #define CG0(nsb)    (((nsb)->nodeid == 0) ? 0 : (nsb)->cgload[(nsb)->nodeid-1])
  62 #define CG1(nsb)    ((nsb)->cgload[(nsb)->nodeid])