include/types/nrnb.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #ifndef _types_nrnb_h
  39 #define _types_nrnb_h
  40
  41
  42 #ifdef __cplusplus
  43 extern "C" {
  44 #endif
  45 #if 0
  46 } /* fixes auto-indentation problems */
  47 #endif
  48
  49
  50 #define eNR_NBKERNEL_NONE -1
  51
  52 enum
  53 {
  54     eNR_NBKERNEL_VDW_VF,
  55     eNR_NBKERNEL_VDW_F,
  56     eNR_NBKERNEL_ELEC_VF,
  57     eNR_NBKERNEL_ELEC_F,
  58     eNR_NBKERNEL_ELEC_W3_VF,
  59     eNR_NBKERNEL_ELEC_W3_F,
  60     eNR_NBKERNEL_ELEC_W3W3_VF,
  61     eNR_NBKERNEL_ELEC_W3W3_F,
  62     eNR_NBKERNEL_ELEC_W4_VF,
  63     eNR_NBKERNEL_ELEC_W4_F,
  64     eNR_NBKERNEL_ELEC_W4W4_VF,
  65     eNR_NBKERNEL_ELEC_W4W4_F,
  66     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_VF,
  67     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_F,
  68     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W3_VF,
  69     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W3_F,
  70     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W3W3_VF,
  71     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W3W3_F,
  72     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W4_VF,
  73     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W4_F,
  74     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W4W4_VF,
  75     eNR_NBKERNEL_ELEC_VDW_W4W4_F,
  76
  77     eNR_NBKERNEL_NR,  /* Total number of interaction-specific kernel entries */
  78
  79     eNR_NBKERNEL_GENERIC = eNR_NBKERNEL_NR, /* Reuse number; KERNEL_NR is not an entry itself */
  80     eNR_NBKERNEL_FREE_ENERGY,               /* Add other generic kernels _before_ the free energy one */
  81
  82     eNR_NBKERNEL_ALLVSALL,
  83     eNR_NBKERNEL_ALLVSALLGB,
  84
  85     eNR_NBNXN_DIST2,
  86     eNR_NBNXN_LJ_RF,    eNR_NBNXN_LJ_RF_E,
  87     eNR_NBNXN_LJ_TAB,   eNR_NBNXN_LJ_TAB_E,
  88     eNR_NBNXN_LJ_EWALD, eNR_NBNXN_LJ_EWALD_E,
  89     eNR_NBNXN_LJ,       eNR_NBNXN_LJ_E,
  90     eNR_NBNXN_RF,       eNR_NBNXN_RF_E,
  91     eNR_NBNXN_TAB,      eNR_NBNXN_TAB_E,
  92     eNR_NBNXN_EWALD,    eNR_NBNXN_EWALD_E,
  93     eNR_NB14,
  94     eNR_BORN_RADII_STILL,     eNR_BORN_RADII_HCT_OBC,
  95     eNR_BORN_CHAINRULE,
  96     eNR_BORN_AVA_RADII_STILL, eNR_BORN_AVA_RADII_HCT_OBC,
  97     eNR_BORN_AVA_CHAINRULE,
  98     eNR_WEIGHTS,              eNR_SPREADQ,              eNR_SPREADQBSP,
  99     eNR_GATHERF,              eNR_GATHERFBSP,           eNR_FFT,
 100     eNR_CONV,                 eNR_SOLVEPME,eNR_NS,      eNR_RESETX,
 101     eNR_SHIFTX,               eNR_CGCM,                 eNR_FSUM,
 102     eNR_BONDS,                eNR_G96BONDS,             eNR_FENEBONDS,
 103     eNR_TABBONDS,             eNR_RESTRBONDS,           eNR_LINEAR_ANGLES,
 104     eNR_ANGLES,               eNR_G96ANGLES,            eNR_QANGLES,
 105     eNR_TABANGLES,            eNR_PROPER,               eNR_IMPROPER,
 106     eNR_RB,                   eNR_FOURDIH,              eNR_TABDIHS,
 107     eNR_DISRES,               eNR_ORIRES,               eNR_DIHRES,
 108     eNR_POSRES,               eNR_ANGRES,               eNR_ANGRESZ,
 109     eNR_MORSE,                eNR_CUBICBONDS,           eNR_WALLS,
 110     eNR_POLARIZE,             eNR_ANHARM_POL,
 111     eNR_WPOL,                 eNR_THOLE,                eNR_VIRIAL,
 112     eNR_UPDATE,               eNR_EXTUPDATE,            eNR_STOPCM,
 113     eNR_PCOUPL,               eNR_EKIN,                 eNR_LINCS,
 114     eNR_LINCSMAT,             eNR_SHAKE,                eNR_CONSTR_V,
 115     eNR_SHAKE_RIJ,            eNR_CONSTR_VIR,           eNR_SETTLE,
 116     eNR_VSITE2,               eNR_VSITE3,               eNR_VSITE3FD,
 117     eNR_VSITE3FAD,            eNR_VSITE3OUT,            eNR_VSITE4FD,
 118     eNR_VSITE4FDN,            eNR_VSITEN,               eNR_GB,
 119     eNR_CMAP,
 120     eNRNB
 121 };
 122
 123
 124 typedef struct
 125 {
 126     double n[eNRNB];
 127 }
 128 t_nrnb;
 129
 130
 131 typedef struct gmx_wallcycle *gmx_wallcycle_t;
 132
 133 #ifdef __cplusplus
 134 }
 135 #endif
 136
 137 #endif