include/types/nrnb.h

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.0
  10  *
  11  * Copyright (c) 1991-2001
  12  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  13  * University of Groningen, The Netherlands
  14  *
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Good ROcking Metal Altar for Chronical Sinners
  34  */
  35 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  36 #include <config.h>
  37 #endif
  38
  39 /* Oh my god, it's full of loops!
  40  * There are quite a few innerloops, so they have been given numbers
  41  * instead of names. The first figure is the coulomb alternative, the
  42  * second vdw, the third the solvent opt and finally the fourth free
  43  * energy. 0 implies no, none or turned off. The other figugures mean:
  44  *                                     value
  45  * pos              1                   2           3             4
  46  * 1st Coul      Normal           Reaction-field  Table
  47  * 2nd Vdw       Lennard-Jones    Buckingham      Table        Bham-table
  48  * 3rd Sol       General solvent  Water           Water-Water
  49  * 4th FreeEner  Lambda           Softcore
  50  */
  51
  52 #define eNR_INLNONE -1
  53
  54 enum {
  55   eNR_INL0100, eNR_INL0110,
  56   eNR_INL0200, eNR_INL0210,
  57   eNR_INL0300, eNR_INL0310,
  58   eNR_INL0301, eNR_INL0302,
  59   eNR_INL0400, eNR_INL0410,
  60   eNR_INL0401, eNR_INL0402, eNR_INL1000, eNR_INL1010,
  61   eNR_INL1020, eNR_INL1030, eNR_INL1100, eNR_INL1110, eNR_INL1120,
  62   eNR_INL1130, eNR_INL1200, eNR_INL1210, eNR_INL1220, eNR_INL1230,
  63   eNR_INL1300, eNR_INL1310, eNR_INL1320, eNR_INL1330, eNR_INL1400,
  64   eNR_INL1410, eNR_INL1420, eNR_INL1430, eNR_INL2000, eNR_INL2010,
  65   eNR_INL2020, eNR_INL2030, eNR_INL2100, eNR_INL2110, eNR_INL2120,
  66   eNR_INL2130, eNR_INL2200, eNR_INL2210, eNR_INL2220, eNR_INL2230,
  67   eNR_INL2300, eNR_INL2310, eNR_INL2320, eNR_INL2330, eNR_INL2400,
  68   eNR_INL2410, eNR_INL2420, eNR_INL2430, eNR_INL3000, eNR_INL3001,
  69   eNR_INL3002, eNR_INL3010, eNR_INL3020, eNR_INL3030, eNR_INL3100,
  70   eNR_INL3110, eNR_INL3120, eNR_INL3130, eNR_INL3200, eNR_INL3210,
  71   eNR_INL3220, eNR_INL3230, eNR_INL3300, eNR_INL3301, eNR_INL3302,
  72   eNR_INL3310, eNR_INL3320, eNR_INL3330, eNR_INL3400, eNR_INL3401,
  73   eNR_INL3402, eNR_INL3410, eNR_INL3420, eNR_INL3430, eNR_INLOOP,
  74   eNR_INL_IATOM=eNR_INLOOP,
  75   eNR_WEIGHTS,              eNR_SPREADQ,              eNR_SPREADQBSP,
  76   eNR_GATHERF,              eNR_GATHERFBSP,           eNR_FFT,
  77   eNR_CONV,                 eNR_SOLVEPME,eNR_NS,      eNR_RESETX,
  78   eNR_SHIFTX,               eNR_CGCM,                 eNR_FSUM,
  79   eNR_BONDS,                eNR_G96BONDS,             eNR_ANGLES,
  80   eNR_G96ANGLES,            eNR_PROPER,               eNR_IMPROPER,
  81   eNR_RB,                   eNR_DISRES,               eNR_POSRES,
  82   eNR_ANGRES,               eNR_ANGRESZ,              eNR_MORSE,
  83   eNR_CUBICBONDS,           eNR_WPOL,                 eNR_VIRIAL,
  84   eNR_UPDATE,               eNR_EXTUPDATE,            eNR_STOPCM,
  85   eNR_PCOUPL,               eNR_EKIN,                 eNR_LINCS,
  86   eNR_LINCSMAT,             eNR_SHAKE,                eNR_SHAKE_V,
  87   eNR_SHAKE_RIJ,            eNR_SHAKE_VIR,            eNR_SETTLE,
  88   eNR_PSHAKEINITLD,         eNR_PSHAKEINITMD,         eNR_PSHAKE,
  89   eNR_DUM2,                 eNR_DUM3,                 eNR_DUM3FD,
  90   eNR_DUM3FAD,              eNR_DUM3OUT,              eNR_DUM4FD,
  91   eNRNB
  92 };
  93
  94
  95 typedef struct {
  96   double n[eNRNB];
  97 } t_nrnb;
  98
  99