include/types/nlistheuristics.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 #ifndef _nlistheuristics_h
  39 #define _nlistheuristics_h
  40 #include "visibility.h"
  41 #ifdef __cplusplus
  42 extern "C" {
  43 #endif
  44
  45 #if 0
  46 }
  47 /* Hack to make automatic indenting work */
  48 #endif
  49
  50 typedef struct {
  51     gmx_bool       bGStatEveryStep;
  52     gmx_large_int_t step_ns;
  53     gmx_large_int_t step_nscheck;
  54     gmx_large_int_t nns;
  55     matrix     scale_tot;
  56     int        nabnsb;
  57     double     s1;
  58     double     s2;
  59     double     ab;
  60     double     lt_runav;
  61     double     lt_runav2;
  62 } gmx_nlheur_t;
  63
  64 void reset_nlistheuristics(gmx_nlheur_t *nlh,gmx_large_int_t step);
  65
  66 GMX_LIBMD_EXPORT
  67 void init_nlistheuristics(gmx_nlheur_t *nlh,
  68                           gmx_bool bGStatEveryStep,gmx_large_int_t step);
  69
  70 void update_nliststatistics(gmx_nlheur_t *nlh,gmx_large_int_t step);
  71
  72 GMX_LIBMD_EXPORT
  73 void set_nlistheuristics(gmx_nlheur_t *nlh,gmx_bool bReset,gmx_large_int_t step);
  74
  75 #ifdef __cplusplus
  76 }
  77 #endif
  78
  79 #endif