added Verlet scheme and NxN non-bonded functionality
[alexxy/gromacs.git] / include / types / nbnxn_cuda_types_ext.h
1 /* -*- mode: c; tab-width: 4; indent-tabs-mode: nil; c-basic-offset: 4; c-file-style: "stroustrup"; -*-
2  *
3  *
4  *                This source code is part of
5  *
6  *                 G   R   O   M   A   C   S
7  *
8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
9  *
10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
12  * Copyright (c) 2001-2012, The GROMACS development team,
13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
14  *
15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
18  * of the License, or (at your option) any later version.
19  *
20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
26  *
27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
29  *
30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
31  *
32  * And Hey:
33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
34  */
35
36 #ifndef NBNXN_CUDA_TYPES_EXT_H
37 #define NBNXN_CUDA_TYPES_EXT_H
38
39 #ifdef __cplusplus
40 extern "C" {
41 #endif
42
43 /* Abstract types */
44 /* CUDA nonbonded structure */
45 typedef struct nbnxn_cuda *nbnxn_cuda_ptr_t;
46 /* CUDA GPU device info */
47 typedef struct cuda_dev_info *cuda_dev_info_ptr_t;
48
49 /* Types defined for the structs below. */
50 typedef struct wallclock_gpu wallclock_gpu_t;
51 typedef struct nbnxn_cuda_ktime nbnxn_cuda_ktime_t;
52
53 /* Nonbonded kernel time and call count. */
54 struct nbnxn_cuda_ktime
55 {
56     double  t;
57     int     c;
58 }; 
59
60 /* GPU timings for kernels and H2d/D2H transfers. */
61 struct wallclock_gpu
62 {
63     nbnxn_cuda_ktime_t ktime[2][2]; /* table containing the timings of the four 
64                                        version of the nonbonded kernels: force-only, 
65                                        force+energy, force+pruning, and force+energy+pruning */
66     double  nb_h2d_t;               /* host to device transfer time in nb calculation  */
67     double  nb_d2h_t;               /* device to host transfer time in nb calculation */
68     int     nb_c;                   /* total call count of the nonbonded gpu operations */
69     double  pl_h2d_t;               /* pair search step host to device transfer time */
70     int     pl_h2d_c;               /* pair search step  host to device transfer call count */
71 };
72
73 #ifdef __cplusplus
74 }
75 #endif
76
77 #endif /* NBNXN_CUDA_TYPES_EXT_H */