include/types/graph.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *       This source code is part of
   5  *
   6  *        G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  * GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *               VERSION 2.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-1999
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * Please refer to:
  17  * GROMACS: A message-passing parallel molecular dynamics implementation
  18  * H.J.C. Berendsen, D. van der Spoel and R. van Drunen
  19  * Comp. Phys. Comm. 91, 43-56 (1995)
  20  *
  21  * Also check out our WWW page:
  22  * http://md.chem.rug.nl/~gmx
  23  * or e-mail to:
  24  * gromacs@chem.rug.nl
  25  *
  26  * And Hey:
  27  * Green Red Orange Magenta Azure Cyan Skyblue
  28  */
  29
  30 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  31 #include <config.h>
  32 #endif
  33
  34 #include "fatal.h"
  35
  36 typedef struct {
  37   int      maxbond;     /* Max number of bonds per atom                 */
  38   int      nnodes;      /* The number of nodes                          */
  39   int      nbound;      /* The number of nodes with edges               */
  40   int      start;       /* The first atom in this graph                 */
  41   int      end;         /* The last atom in this graph                  */
  42   int      *nedge;      /* For each node the number of edges            */
  43   atom_id  **edge;      /* For each node, the actual edges (bidirect.)  */
  44   ivec     *ishift;     /* Shift for each particle                      */
  45 } t_graph;
  46
  47
  48
  49 #define SHIFT_IVEC(g,i) ((g)->ishift[(i)-(g)->start])
  50