include/struc2.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *                        VERSION 3.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-2001
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  17  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  18  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  19  * of the License, or (at your option) any later version.
  20  *
  21  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  22  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  23  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  24  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  25  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  26  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  27  *
  28  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  29  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  30  *
  31  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  32  *
  33  * And Hey:
  34  * Giving Russians Opium May Alter Current Situation
  35  */
  36
  37 #ifndef _struc2_h
  38 #define _struc2_h
  39
  40 static char *SRCID_struc2_h = "$Id$";
  41 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  42 #include <config.h>
  43 #endif
  44
  45 #ifdef HAVE_IDENT
  46 #ident  "@(#) struc2.h 1.2 15 Sep 1993"
  47 #endif /* HAVE_IDENT */
  48 #include "typedefs.h"
  49
  50 typedef struct {
  51   atom_id d;
  52   atom_id a;
  53   atom_id h;
  54 } t_dah;
  55
  56 typedef struct {
  57   real  a_dist;
  58   real  h_dist;
  59   real  d_dist;
  60   int   nr;
  61 } t_water;
  62
  63
  64 typedef struct {
  65   real    distance_ad;
  66   real    distance_ah;
  67   real    angle;
  68   bool    h_bond;
  69   t_water water;
  70 } t_info;
  71
  72 typedef struct {
  73   t_info *info;
  74   atom_id  a;
  75   atom_id  d;
  76   atom_id  h;
  77   int    monitor;
  78 } t_hbond;
  79
  80 typedef struct {
  81   int     nrt;
  82   int     nr;
  83   t_hbond *hbond;
  84   real    *time;
  85 } t_list;
  86
  87 extern void determine_2struc(FILE *out,t_topology *top,t_list *list);
  88
  89 #endif  /* _struc2_h */