6039da1d4d4933b0e74ae449a4d80e7cbc16679f
[alexxy/gromacs.git] / include / splitter.h
1 /*
2  * 
3  *                This source code is part of
4  * 
5  *                 G   R   O   M   A   C   S
6  * 
7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
8  * 
9  *                        VERSION 3.2.0
10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
14
15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
18  * of the License, or (at your option) any later version.
19  * 
20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
26  * 
27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
29  * 
30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
31  * 
32  * And Hey:
33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
34  */
35  
36 #ifndef _splitter_h
37 #define _splitter_h
38 #include "visibility.h"
39 #include "typedefs.h"
40 #include "types/inputrec.h"
41
42 #ifdef __cplusplus
43 extern "C" {
44 #endif
45
46 GMX_LIBGMX_EXPORT
47 void split_top(FILE *fp,int nnodes,gmx_localtop_t *top,
48                       t_inputrec *ir,t_block *mols,
49                       real *capacity,int *mulitnr_cgs,int **multinr_nre,
50                       int *left_range, int *right_range);
51 /* Split the topology (blocks and forces, based on charge groups 
52  * and shake blocks.
53  * The capacity is releated to the capacity of each node. If all numbers are 
54  * equal, load will be distributed equally. If not some (the higher ones)
55  * will get more than others. The sum of capacities should be 1.
56  * Info is written to the file pointer fp.
57  */
58
59 GMX_LIBGMX_EXPORT
60 void gen_sblocks(FILE *fp,int at_start,int at_end,
61                         t_idef *idef,t_blocka *sblock,
62                         gmx_bool bSettle);
63 /* Generate shake blocks from the constraint list. Set bSettle to yes for shake
64  * blocks including settles. You normally do not want this.
65  */
66
67 #ifdef __cplusplus
68 }
69 #endif
70
71 #endif