include/sortwater.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *                        VERSION 3.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-2001
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  17  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  18  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  19  * of the License, or (at your option) any later version.
  20  *
  21  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  22  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  23  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  24  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  25  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  26  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  27  *
  28  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  29  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  30  *
  31  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  32  *
  33  * And Hey:
  34  * Good ROcking Metal Altar for Chronical Sinners
  35  */
  36
  37 #ifndef _sortwater_h
  38 #define _sortwater_h
  39
  40 static char *SRCID_sortwater_h = "$Id$";
  41 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  42 #include <config.h>
  43 #endif
  44
  45 #include "typedefs.h"
  46
  47 extern void randwater(int astart,int nwater,int nwatom,
  48                       rvec x[],rvec v[],int *seed);
  49 /* Randomize the order of nwater molecules of length nwatom, the
  50  * first atom of which is at astart.
  51  * If v is not NULL it will be shuffled along
  52  */
  53
  54
  55 extern void sortwater(int astart,int nwater,int nwatom,rvec x[],rvec v[]);
  56 /* Sort the order of nwater molecules of length nwatom on X coordinate
  57  * If v is not NULL it will be shuffled along
  58  */
  59
  60 extern void mkcompact(int astart,int nwater,int nwatom,rvec x[],rvec v[],
  61                       int nnode,matrix box);
  62 /* Make compact subboxes */
  63
  64 #endif