include/selvalue.h

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  10  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  11  * Copyright (c) 2001-2009, The GROMACS development team,
  12  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  13
  14  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  15  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  16  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  17  * of the License, or (at your option) any later version.
  18  *
  19  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  20  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  21  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  22  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  23  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  24  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  25  *
  26  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  27  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  28  *
  29  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  30  */
  31 /*! \file
  32  * \brief Declaration of \c gmx_ana_selvalue_t.
  33  *
  34  * There should be no need to use the data structures in this file directly
  35  * unless implementing a custom selection routine.
  36  */
  37 #ifndef SELVALUE_H
  38 #define SELVALUE_H
  39
  40 #include "types/simple.h"
  41
  42 #ifdef __cplusplus
  43 extern "C"
  44 {
  45 #endif
  46
  47 /** Defines the value type of a different selection objects. */
  48 typedef enum
  49 {
  50     NO_VALUE,           /**< No value; either an error condition or an gmx_boolean
  51                              parameter. */
  52     INT_VALUE,          /**< One or more integer values. */
  53     REAL_VALUE,         /**< One or more real values. */
  54     STR_VALUE,          /**< One or more string values. */
  55     POS_VALUE,          /**< One or more position values. */
  56     GROUP_VALUE         /**< One group of atoms. */
  57 } e_selvalue_t;
  58
  59 /*! \brief
  60  * Describes a value of a selection expression or of a selection method
  61  * parameter.
  62  *
  63  * Which field in the union is used depends on the \p type.
  64  */
  65 typedef struct gmx_ana_selvalue_t
  66 {
  67     /** Type of the value. */
  68     e_selvalue_t                type;
  69     /*! \brief
  70      * Number of values in the array pointed by the union.
  71      *
  72      * Note that for position and group values, it is the number of
  73      * data structures in the array, not the number of positions or
  74      * the number of atoms in the group.
  75      */
  76     int                         nr;
  77     /** Pointer to the value. */
  78     union {
  79         /*! \brief
  80          * Generic pointer for operations that do not need type information.
  81          *
  82          * Needs to be the first member to be able to use initialized arrays.
  83          */
  84         void                   *ptr;
  85         /** Integer value(s) (type \ref INT_VALUE). */
  86         int                    *i;
  87         /** Real value(s) (type \ref REAL_VALUE). */
  88         real                   *r;
  89         /** String value(s) (type \ref STR_VALUE). */
  90         char                  **s;
  91         /** Structure for the position value(s) (type \ref POS_VALUE). */
  92         struct gmx_ana_pos_t   *p;
  93         /** Group value (type \ref GROUP_VALUE). */
  94         struct gmx_ana_index_t *g;
  95         /** Boolean value (only parameters of type \ref NO_VALUE); */
  96         gmx_bool                   *b;
  97     }                           u;
  98     /*! \brief
  99      * Number of elements allocated for the value array.
 100      */
 101     int                         nalloc;
 102 } gmx_ana_selvalue_t;
 103
 104 /** Initializes an empty selection value structure. */
 105 void
 106 _gmx_selvalue_clear(gmx_ana_selvalue_t *val);
 107 /** Reserve memory for storing selection values. */
 108 int
 109 _gmx_selvalue_reserve(gmx_ana_selvalue_t *val, int n);
 110 /** Sets the memory for storing selection values. */
 111 int
 112 _gmx_selvalue_setstore(gmx_ana_selvalue_t *val, void *ptr);
 113 /** Sets the memory for storing selection values and marks it for automatic freeing. */
 114 int
 115 _gmx_selvalue_setstore_alloc(gmx_ana_selvalue_t *val, void *ptr, int nalloc);
 116
 117 #ifdef __cplusplus
 118 }
 119 #endif
 120
 121 #endif