include/resall.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _resall_h
  40 #define _resall_h
  41 #include "visibility.h"
  42 #include "typedefs.h"
  43 #include "hackblock.h"
  44 #include "gpp_atomtype.h"
  45 #include "grompp.h"
  46
  47 #ifdef __cplusplus
  48 extern "C" {
  49 #endif
  50
  51 char *search_rtp(const char *key,int nrtp,t_restp rtp[]);
  52 /* Search for an entry in the rtp database, returns the rtp residue name.
  53  * A mismatch of one character is allowed, if there is only one nearly
  54  * matching entry in the database, a warning will be generated.
  55  */
  56
  57 t_restp *get_restp(const char *rtpname,int nrtp,t_restp rtp[]);
  58 /* Return the entry in the rtp database with rtp name rtpname.
  59  * Generates a fatal error when rtpname is not found.
  60  */
  61
  62 GMX_LIBGMXPREPROCESS_EXPORT
  63 gpp_atomtype_t read_atype(const char *ffdir,t_symtab *tab);
  64 /* read atom type database(s) */
  65
  66 GMX_LIBGMXPREPROCESS_EXPORT
  67 void read_resall(char *resdb, int *nrtp,t_restp **rtp,
  68                  gpp_atomtype_t atype, t_symtab *tab,
  69                  gmx_bool bAllowOverrideRTP);
  70 /* read rtp database, append to the existing database */
  71
  72 GMX_LIBGMXPREPROCESS_EXPORT
  73 void print_resall(FILE *out, int nrtp, t_restp rtp[],
  74                          gpp_atomtype_t atype);
  75 /* write rtp database */
  76 #ifdef __cplusplus
  77 }
  78 #endif
  79
  80 #endif  /* _resall_h */