include/reorder.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *                        VERSION 3.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-2001
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  17  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  18  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  19  * of the License, or (at your option) any later version.
  20  *
  21  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  22  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  23  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  24  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  25  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  26  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  27  *
  28  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  29  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  30  *
  31  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  32  *
  33  * And Hey:
  34  * GRoups of Organic Molecules in ACtion for Science
  35  */
  36
  37 #ifndef _reorder_h
  38 #define _reorder_h
  39
  40 static char *SRCID_reorder_h = "$Id$";
  41 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  42 #include <config.h>
  43 #endif
  44
  45 #ifdef HAVE_IDENT
  46 #ident  "@(#) reorder.h 1.4 11/23/92"
  47 #endif /* HAVE_IDENT */
  48
  49 extern void reorder(t_topology *topin,t_topology topout[],
  50                     int nnodes,int load[],int tload[]);
  51      /*
  52       * All atoms used in topin are distributed over nnodes topologies in
  53       * topout, where all atom id's are reset, start counting at zero. The
  54       * bonded force parameters of topin are distributed using the highest
  55       * atom id of a bond. The bonds is then placed on the node where
  56       * this atom is a home particle. Due to the algorithm, a node
  57       * receives the rest of its subsystem from the nodes with a lower
  58       * number (modulo nnodes). The array load specifies the number of atom
  59       * to be allocated to every node.
  60       */
  61
  62 #endif  /* _reorder_h */