include/renum.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *       This source code is part of
   5  *
   6  *        G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  * GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *               VERSION 2.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-1999
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * Please refer to:
  17  * GROMACS: A message-passing parallel molecular dynamics implementation
  18  * H.J.C. Berendsen, D. van der Spoel and R. van Drunen
  19  * Comp. Phys. Comm. 91, 43-56 (1995)
  20  *
  21  * Also check out our WWW page:
  22  * http://md.chem.rug.nl/~gmx
  23  * or e-mail to:
  24  * gromacs@chem.rug.nl
  25  *
  26  * And Hey:
  27  * Green Red Orange Magenta Azure Cyan Skyblue
  28  */
  29
  30 #ifndef _renum_h
  31 #define _renum_h
  32
  33 static char *SRCID_renum_h = "$Id$";
  34
  35 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  36 #include <config.h>
  37 #endif
  38
  39 #ifdef HAVE_IDENT
  40 #ident  "@(#) renum.h 1.6 11/23/92"
  41 #endif /* HAVE_IDENT */
  42
  43 #include "typedefs.h"
  44
  45 extern void renum_params(t_topology *top,int renum[]);
  46      /*
  47       * The atom id's in the parameters for the bonded forces will be
  48       * renumbered according to the order specified in renum.
  49       *
  50       * renum[i]=j specifies that atom i will be at postion j after
  51       * renum_params.
  52       */
  53
  54 extern void renumber_top(t_topology *top,rvec *x,rvec *v,rvec *f,int renum[]);
  55      /*
  56       * All atoms in the topology top will be renumbered according to the order
  57       * specified in renum. The vector array's x,v & f will also be renumbered.
  58       *
  59       * renum[i]=j specifies that atom i will be at postion j after
  60       * renumber_top.
  61       */
  62
  63 #endif  /* _renum_h */