include/random.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *                        VERSION 3.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-2001
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  17  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  18  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  19  * of the License, or (at your option) any later version.
  20  *
  21  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  22  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  23  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  24  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  25  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  26  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  27  *
  28  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  29  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  30  *
  31  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  32  *
  33  * And Hey:
  34  * Giving Russians Opium May Alter Current Situation
  35  */
  36
  37 #ifndef _random_h
  38 #define _random_h
  39
  40 static char *SRCID_random_h = "$Id$";
  41 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  42 #include <config.h>
  43 #endif
  44
  45 #ifdef HAVE_IDENT
  46 #ident  "@(#) random.h 1.5 12/16/92"
  47 #endif /* HAVE_IDENT */
  48
  49 #include <typedefs.h>
  50
  51 extern real gauss(real am, real sd, int *ig);
  52 /* Generate a gaussian number with:
  53  * am = center of the distribution
  54  * sd = standard deviation
  55  * ig = the random number seed.
  56  */
  57
  58 extern int make_seed(void);
  59 /* Make a random seed: (time+getpid) % 1000000 */
  60
  61 extern real rando(int *ig);
  62 /* Generate a random number 0 <= r < 1. ig is the (address of) the
  63  * seed variable.
  64  */
  65
  66 extern void grp_maxwell(t_block *grp,real tempi[],int nrdf[],int seed,
  67                         t_atoms *atoms,rvec v[]);
  68 /* Generate for each group in grp a temperature.
  69  * When seed = -1, set the seed to make_seed.
  70  */
  71
  72 extern void maxwell_speed(real tempi,int nrdf,int seed,
  73                           t_atoms *atoms, rvec v[]);
  74 /* Generate velocites according to a maxwellian distribution */
  75
  76 extern real calc_cm(FILE *log,int natoms,real mass[],rvec x[],rvec v[],
  77                     rvec xcm,rvec vcm,rvec acm,matrix L);
  78 /* Calculate the c.o.m. position, velocity, acceleration and the
  79  * moment of Inertia. Returns the total mass.
  80  */
  81
  82 extern void stop_cm(FILE *log,int natoms,real mass[],rvec x[],rvec v[]);
  83
  84 #endif  /* _random_h */