added Verlet scheme and NxN non-bonded functionality
[alexxy/gromacs.git] / include / nrnb.h
1 /*
2  * 
3  *                This source code is part of
4  * 
5  *                 G   R   O   M   A   C   S
6  * 
7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
8  * 
9  *                        VERSION 3.2.0
10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
14
15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
18  * of the License, or (at your option) any later version.
19  * 
20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
26  * 
27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
29  * 
30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
31  * 
32  * And Hey:
33  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
34  */
35
36 #ifndef _nrnb_h
37 #define _nrnb_h
38
39 #include "typedefs.h"
40 #include "types/commrec.h"
41
42 #ifdef __cplusplus
43 extern "C" {
44 #endif
45
46 void init_nrnb(t_nrnb *nrnb);
47
48 void cp_nrnb(t_nrnb *dest, t_nrnb *src);
49
50 void add_nrnb(t_nrnb *dest, t_nrnb *s1, t_nrnb *s2);
51
52 void print_nrnb(FILE *out, t_nrnb *nrnb);
53
54 void _inc_nrnb(t_nrnb *nrnb,int enr,int inc,char *file,int line);
55
56 #if DEBUG_NRNB
57 #define inc_nrnb(nrnb,enr,inc) _inc_nrnb(nrnb,enr,inc,__FILE__,__LINE__)
58 #else
59 #define inc_nrnb(nrnb,enr,inc) (nrnb)->n[enr] += inc
60 #endif
61
62  
63 void print_flop(FILE *out,t_nrnb *nrnb,double *nbfs,double *mflop);
64 /* Calculates the non-bonded forces and flop count.
65  * When out!=NULL also prints the full count table.
66  */
67
68 void print_perf(FILE *out,double nodetime,double realtime,int nprocs,
69                        gmx_large_int_t nsteps,real delta_t,
70                        double nbfs,double mflop,
71                        int omp_nth_pp);
72 /* Prints the performance, nbfs and mflop come from print_flop */
73
74 void pr_load(FILE *log,t_commrec *cr,t_nrnb nrnb[]);
75 /* Print detailed load balancing info */
76
77 int cost_nrnb(int enr);
78 /* Cost in i860 cycles of this component of MD */
79
80 const char *nrnb_str(int enr);
81 /* Name of this component */
82
83 #ifdef __cplusplus
84 }
85 #endif
86
87 #endif  /* _nrnb_h */