include/mvdata.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _mvdata_h
  40 #define _mvdata_h
  41 #include "visibility.h"
  42 #include "typedefs.h"
  43 #include "types/commrec.h"
  44
  45 #ifdef __cplusplus
  46 extern "C" {
  47 #endif
  48
  49 GMX_LIBGMX_EXPORT
  50 void bcast_ir_mtop(const t_commrec *cr,
  51                    t_inputrec *inputrec, gmx_mtop_t *mtop);
  52 /* Broadcasts ir and mtop from the master to all nodes in cr->mpi_comm_mygroup.
  53  */
  54
  55 GMX_LIBGMX_EXPORT
  56 void bcast_state_setup(const t_commrec *cr, t_state *state);
  57 /* Broadcasts the state sizes and flags
  58  * from the master to all nodes in cr->mpi_comm_mygroup.
  59  * The arrays are not broadcasted.
  60  */
  61
  62 GMX_LIBGMX_EXPORT
  63 void bcast_state(const t_commrec *cr, t_state *state, gmx_bool bAlloc);
  64 /* Broadcasts state from the master to all nodes in cr->mpi_comm_mygroup.
  65  * The arrays in state are allocated when bAlloc is TRUE.
  66  */
  67
  68
  69 /* Routines for particle decomposition only in mvxvf.c */
  70
  71 void move_cgcm(FILE *log, const t_commrec *cr, rvec cg_cm[]);
  72
  73 GMX_LIBMD_EXPORT
  74 void move_rvecs(const t_commrec *cr, gmx_bool bForward, gmx_bool bSum,
  75                 int left, int right, rvec vecs[], rvec buf[],
  76                 int shift, t_nrnb *nrnb);
  77
  78 void move_reals(const t_commrec *cr, gmx_bool bForward, gmx_bool bSum,
  79                 int left, int right, real reals[], real buf[],
  80                 int shift, t_nrnb *nrnb);
  81
  82 void move_x(FILE *log, const t_commrec *cr,
  83             int left, int right, rvec x[], t_nrnb *nrnb);
  84
  85 void move_rborn(FILE *log, const t_commrec *cr,
  86                 int left, int right, real rborn[], t_nrnb *nrnb);
  87
  88 void move_f(FILE *log, const t_commrec *cr,
  89             int left, int right, rvec f[], rvec fadd[],
  90             t_nrnb *nrnb);
  91
  92 void move_gpol(FILE *log, const t_commrec *cr,
  93                int left, int right, real gpol[], real gpol_add[],
  94                t_nrnb *nrnb);
  95
  96 #ifdef __cplusplus
  97 }
  98 #endif
  99
 100 #endif  /* _mvdata_h */