include/mdebin.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *                        VERSION 3.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-2001
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  17  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  18  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  19  * of the License, or (at your option) any later version.
  20  *
  21  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  22  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  23  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  24  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  25  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  26  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  27  *
  28  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  29  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  30  *
  31  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  32  *
  33  * And Hey:
  34  * Giving Russians Opium May Alter Current Situation
  35  */
  36
  37 #ifndef _mdebin_h
  38 #define _mdebin_h
  39
  40 static char *SRCID_mdebin_h = "$Id$";
  41 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  42 #include <config.h>
  43 #endif
  44
  45 #ifdef HAVE_IDENT
  46 #ident  "@(#) mdebin.h 1.12 2/2/97"
  47 #endif /* HAVE_IDENT */
  48 #include "typedefs.h"
  49 #include "sysstuff.h"
  50 #include "ebin.h"
  51 #include "enxio.h"
  52
  53 typedef struct {
  54   t_ebin *ebin;
  55   int    ie,ib,isvir,ifvir,ipres,ivir,isurft,itc,iu,imu,ivcos,ivisc;
  56   int    nE,nEg,nEc,nTC,nU;
  57   int    *igrp;
  58 } t_mdebin;
  59
  60 extern t_mdebin *init_mdebin(int fp_ene,t_groups *grps,t_atoms *atoms,
  61                              t_idef *idef,bool bLR,bool BLJLR,bool bBHAM,
  62                              bool b14,bool bFEP,bool bPcoupl,bool
  63                              bDispCorr,bool bTriclinic,bool bNoseHoover, t_commrec *cr);
  64 /* Initiate MD energy bin and write header to energy file. */
  65
  66 extern void upd_mdebin(t_mdebin *md,FILE *fp_dgdl,
  67                        real tmass,int step,real time,
  68                        real ener[],
  69                        matrix box,
  70                        tensor svir,
  71                        tensor fvir,
  72                        tensor vir,
  73                        tensor pres,
  74                        t_groups *grps,
  75                        rvec mu_tot, bool bNoseHoover);
  76
  77 extern void print_ebin_header(FILE *log,int steps,real time,
  78                               real lamb,real SAfactor);
  79
  80 extern void print_ebin(int fp_ene,bool bEne,bool bDR,
  81                        FILE *log,int steps,real time,
  82                        int mode,bool bCompact,
  83                        t_mdebin *md,t_atoms *atoms);
  84
  85 #endif  /* _mdebin_h */
  86