include/main.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _main_h
  40 #define _main_h
  41
  42
  43 #include <stdio.h>
  44 #include "visibility.h"
  45 #include "network.h"
  46
  47 #ifdef __cplusplus
  48 extern "C" {
  49 #endif
  50
  51 char *gmx_gethostname(char *name, size_t len);
  52 /* Sets the hostname to the value given by gethostname, if available,
  53  * and to "unknown" otherwise. name should have at least size len.
  54  * Returns name.
  55  */
  56
  57 GMX_LIBGMX_EXPORT
  58 void gmx_log_open(const char *fn,const t_commrec *cr,
  59                           gmx_bool bMasterOnly, gmx_bool bAppendFiles, FILE**);
  60 /* Open the log file, if necessary (nprocs > 1) the logfile name is
  61  * communicated around the ring.
  62  */
  63
  64 GMX_LIBGMX_EXPORT
  65 void gmx_log_close(FILE *fp);
  66 /* Close the log file */
  67
  68 GMX_LIBGMX_EXPORT
  69 void check_multi_int(FILE *log,const gmx_multisim_t *ms,
  70                             int val,const char *name);
  71 GMX_LIBGMX_EXPORT
  72 void check_multi_large_int(FILE *log,const gmx_multisim_t *ms,
  73                            gmx_large_int_t val,const char *name);
  74 /* Check if val is the same on all processors for a mdrun -multi run
  75  * The string name is used to print to the log file and in a fatal error
  76  * if the val's don't match.
  77  */
  78
  79 void init_multisystem(t_commrec *cr, int nsim, char **multidirs,
  80                       int nfile, const t_filenm fnm[], gmx_bool bParFn);
  81 /* Splits the communication into nsim separate simulations
  82  * and creates a communication structure between the master
  83  * these simulations.
  84  * If bParFn is set, the nodeid is appended to the tpx and each output file.
  85  */
  86
  87 GMX_LIBGMX_EXPORT
  88 t_commrec *init_par(int *argc,char ***argv_ptr);
  89 /* Initiate the parallel computer. Return the communication record
  90  * (see network.h). The command line arguments are communicated so that they can be
  91  * parsed on each processor.
  92  * Arguments are the number of command line arguments, and a pointer to the
  93  * array of argument strings. Both are allowed to be NULL.
  94  */
  95
  96 GMX_LIBGMX_EXPORT
  97 t_commrec *init_par_threads(const t_commrec *cro);
  98 /* Initialize communication records for thread-parallel simulations.
  99    Must be called on all threads before any communication takes place by
 100    the individual threads. Copies the original commrec to
 101    thread-local versions (a small memory leak results because we don't
 102    deallocate the old shared version).  */
 103
 104 #ifdef __cplusplus
 105 }
 106 #endif
 107
 108 #endif  /* _main_h */