include/gmx_blas.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2008, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _GMX_BLAS_H_
  40 #define _GMX_BLAS_H_
  41
  42 #include "types/simple.h"
  43
  44 /* Suppress Cygwin compiler warnings from using newlib version of
  45  * ctype.h */
  46 #ifdef GMX_CYGWIN
  47 #undef toupper
  48 #endif
  49
  50
  51 /** @file
  52  *
  53  *  @brief Header definitions for the standard BLAS library.
  54  *
  55  * This is the subset of BLAS routines used for the
  56  * linear algebra operations in Gromacs.
  57  * Do NOT use this for other purposes - we only provide this as a
  58  * simple fallback/reference implementation when no optimized BLAS
  59  * is present. If you need an implementation for your own code
  60  * there are several much faster versions out there.
  61  *
  62  * All routines are compatible with the BLAS reference implementation,
  63  * meaning they assume fortran-style matrix row/column organization.
  64  *
  65  * There is plenty of documentation for these routines available
  66  * at http://www.netlib.org/blas , so there is no point in repeating
  67  * it here.
  68  */
  69
  70 #ifdef __cplusplus
  71 extern "C" {
  72 #endif
  73 #if 0
  74 }
  75 #endif
  76
  77 /* Double precision versions */
  78 double
  79     F77_FUNC(dasum, DASUM) (int *n, double *dx, int *incx);
  80
  81 void
  82     F77_FUNC(daxpy, DAXPY) (int *n, double *da, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
  83
  84 void
  85     F77_FUNC(dcopy, DCOPY) (int *n, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
  86
  87 double
  88     F77_FUNC(ddot, DDOT) (int *n, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
  89
  90 void
  91     F77_FUNC(dgemm, DGEMM) (const char *transa, const char *transb, int *m, int *n, int *k,
  92                             double *alpha, double *a, int *lda, double *b, int *ldb,
  93                             double *beta, double *c, int *ldc);
  94
  95 void
  96     F77_FUNC(dgemv, DGEMV) (const char *trans, int *m, int *n, double *alpha, double *a, int *lda,
  97                             double *x, int *incx, double *beta, double *y, int *incy);
  98
  99 void
 100     F77_FUNC(dger, DGER) (int *m, int *n, double *alpha, double *x, int *incx,
 101                           double *y, int *incy, double *a, int *lda);
 102
 103 double
 104     F77_FUNC(dnrm2, DNRM2) (int  *n, double *x, int *incx);
 105
 106 void
 107     F77_FUNC(drot, DROT) (int *n, double *dx, int *incx,
 108                           double *dy, int *incy, double *c, double *s);
 109
 110 void
 111     F77_FUNC(dscal, DSCAL) (int *n, double *fact, double *dx, int *incx);
 112
 113 void
 114     F77_FUNC(dswap, DSWAP) (int *n, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
 115
 116 void
 117     F77_FUNC(dsymv, DSYMV) (const char *uplo, int *n, double *alpha, double *a, int *lda,
 118                             double *x, int *incx, double *beta, double *y, int *incy);
 119
 120 void
 121     F77_FUNC(dsyr2, DSYR2) (const char *uplo, int *n, double *alpha, double *x, int *incx,
 122                             double *y, int *incy, double *a, int *lda);
 123
 124 void
 125     F77_FUNC(dsyr2k, DSYR2K) (const char *uplo, const char *trans, int *n, int *k, double *alpha, double *a,
 126                               int *lda, double *b, int *ldb, double *beta, double *c, int *ldc);
 127
 128 void
 129     F77_FUNC(dtrmm, DTRMM) (const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 130                             double *alpha, double *a, int *lda, double *b, int *ldb);
 131
 132 void
 133     F77_FUNC(dtrmv, DTRMV) (const char *uplo, const char *trans, const char *diag, int *n,
 134                             double *a, int *lda, double *x, int *incx);
 135
 136 void
 137     F77_FUNC(dtrsm, DTRSM) (const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 138                             double *alpha, double *a, int *lda, double *b, int *ldb);
 139
 140 int
 141     F77_FUNC(idamax, IDAMAX) (int *n, double *dx, int *incx);
 142
 143
 144
 145 /* Single precision versions */
 146 float
 147     F77_FUNC(sasum, SASUM) (int *n, float *dx, int *incx);
 148
 149 void
 150     F77_FUNC(saxpy, SAXPY) (int *n, float *da, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 151
 152 void
 153     F77_FUNC(scopy, SCOPY) (int *n, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 154
 155 float
 156     F77_FUNC(sdot, SDOT) (int *n, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 157
 158 void
 159     F77_FUNC(sgemm, SGEMM) (const char *transa, const char *transb, int *m, int *n, int *k,
 160                             float *alpha, float *a, int *lda, float *b, int *ldb,
 161                             float *beta, float *c, int *ldc);
 162
 163 void
 164     F77_FUNC(sgemv, SGEMV) (const char *trans, int *m, int *n, float *alpha, float *a, int *lda,
 165                             float *x, int *incx, float *beta, float *y, int *incy);
 166
 167 void
 168     F77_FUNC(sger, SGER) (int *m, int *n, float *alpha, float *x, int *incx,
 169                           float *y, int *incy, float *a, int *lda);
 170
 171 float
 172     F77_FUNC(snrm2, SNRM2) (int  *n, float *x, int *incx);
 173
 174 void
 175     F77_FUNC(srot, SROT) (int *n, float *dx, int *incx,
 176                           float *dy, int *incy, float *c, float *s);
 177
 178 void
 179     F77_FUNC(sscal, SSCAL) (int *n, float *fact, float *dx, int *incx);
 180
 181 void
 182     F77_FUNC(sswap, SSWAP) (int *n, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 183
 184 void
 185     F77_FUNC(ssymv, SSYMV) (const char *uplo, int *n, float *alpha, float *a, int *lda,
 186                             float *x, int *incx, float *beta, float *y, int *incy);
 187
 188 void
 189     F77_FUNC(ssyr2, SSYR2) (const char *uplo, int *n, float *alpha, float *x, int *incx,
 190                             float *y, int *incy, float *a, int *lda);
 191
 192 void
 193     F77_FUNC(ssyr2k, SSYR2K) (const char *uplo, const char *trans, int *n, int *k, float *alpha, float *a,
 194                               int *lda, float *b, int *ldb, float *beta, float *c, int *ldc);
 195
 196 void
 197     F77_FUNC(strmm, STRMM) (const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 198                             float *alpha, float *a, int *lda, float *b, int *ldb);
 199
 200 void
 201     F77_FUNC(strmv, STRMV) (const char *uplo, const char *trans, const char *diag, int *n,
 202                             float *a, int *lda, float *x, int *incx);
 203
 204 void
 205     F77_FUNC(strsm, STRSM) (const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 206                             float *alpha, float *a, int *lda, float *b, int *ldb);
 207
 208 int
 209     F77_FUNC(isamax, ISAMAX) (int *n, float *dx, int *incx);
 210
 211
 212 #ifdef __cplusplus
 213 }
 214 #endif
 215
 216
 217
 218 #endif /* _BLAS_H_ */