include/force.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *       This source code is part of
   5  *
   6  *        G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  * GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *               VERSION 2.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-1999
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * Please refer to:
  17  * GROMACS: A message-passing parallel molecular dynamics implementation
  18  * H.J.C. Berendsen, D. van der Spoel and R. van Drunen
  19  * Comp. Phys. Comm. 91, 43-56 (1995)
  20  *
  21  * Also check out our WWW page:
  22  * http://md.chem.rug.nl/~gmx
  23  * or e-mail to:
  24  * gromacs@chem.rug.nl
  25  *
  26  * And Hey:
  27  * Good ROcking Metal Altar for Chronical Sinners
  28  */
  29
  30 #ifndef _force_h
  31 #define _force_h
  32
  33 static char *SRCID_force_h = "$Id$";
  34
  35 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  36 #include <config.h>
  37 #endif
  38
  39 #ifdef HAVE_IDENT
  40 #ident  "@(#) force.h 1.53 5/15/97"
  41 #endif /* HAVE_IDENT */
  42 #include "typedefs.h"
  43 #include "pbc.h"
  44 #include "nsb.h"
  45 #include "network.h"
  46 #include "tgroup.h"
  47
  48
  49 extern void calc_vir(FILE *log,int nxf,rvec x[],rvec f[],tensor vir,
  50                      t_commrec *cr);
  51 /* Calculate virial for nxf atoms, and add it to vir */
  52
  53 extern void f_calc_vir(FILE *log,int i0,int i1,rvec x[],rvec f[],tensor vir,
  54                        t_commrec *cr,t_graph *g,rvec shift_vec[]);
  55 /* Calculate virial taking periodicity into account */
  56
  57 extern t_forcerec *mk_forcerec(void);
  58
  59 extern void make_tables(FILE *fp,t_forcerec *fr,bool bVerbose,char *fn);
  60 /* Make tables for inner loops. When bVerbose the tables are printed
  61  * to .xvg files
  62  */
  63
  64 extern void pr_forcerec(FILE *log,t_forcerec *fr,t_commrec *cr);
  65
  66 extern void init_forcerec(FILE       *log,
  67                           t_forcerec *fr,
  68                           t_inputrec *ir,
  69                           t_topology *top,
  70                           t_commrec  *cr,
  71                           t_mdatoms  *mdatoms,
  72                           t_nsborder *nsb,
  73                           matrix     box,
  74                           bool       bMolEpot,
  75                           char       *tabfn);
  76 /* The Force rec struct must be created with mk_forcerec
  77  * The booleans have the following meaning:
  78  * bSetQ:    Copy the charges [ only necessary when they change ]
  79  * bMolEpot: Use the free energy stuff per molecule
  80  */
  81
  82 extern void update_forcerec(FILE *log,t_forcerec *fr,matrix box);
  83 /* Updates parameters in the forcerec that are time dependent */
  84
  85 extern void set_avcsix(FILE *log,t_forcerec *fr,t_mdatoms *mdatoms);
  86 /* Compute the average C6 param for LJ corrections */
  87
  88 extern void ns(FILE *log,
  89                t_forcerec *fr,
  90                rvec       x[],
  91                rvec       f[],
  92                matrix     box,
  93                t_groups   *grps,
  94                t_grpopts  *opts,
  95                t_topology *top,
  96                t_mdatoms  *md,
  97                t_commrec  *cr,
  98                t_nrnb     *nrnb,
  99                t_nsborder *nsb,
 100                int        step,
 101                real       lambda,
 102                real       *dvdlambda);
 103 /* Call the neighborsearcher */
 104
 105 extern void force(FILE *log,
 106                   int          step,
 107                   t_forcerec   *fr,
 108                   t_inputrec   *ir,
 109                   t_idef       *idef,
 110                   t_nsborder   *nsb,
 111                   t_commrec    *cr,
 112                   t_nrnb       *nrnb,
 113                   t_groups     *grps,
 114                   t_mdatoms    *md,
 115                   int          ngener,
 116                   t_grpopts    *opts,
 117                   rvec x[],
 118                   rvec f[],
 119                   real epot[], bool bVerbose,
 120                   matrix       box,
 121                   real         lambda,
 122                   t_graph      *graph,
 123                   t_block      *excl,
 124                   bool         bNBonly,
 125                   matrix       lr_vir,
 126                   rvec         mu_tot,
 127                   real         qsum,
 128                   bool         bGatherOnly);
 129 /* Call all the force routines */
 130
 131 /* Routine from fnbf.m4 */
 132 extern void do_fnbf(FILE *log,t_commrec *cr,t_forcerec *fr,
 133                     rvec x[],rvec f[],t_mdatoms *md,
 134                     real egnb[],real egcoul[],rvec box_size,
 135                     t_nrnb *nrnb,real lambda,real *dvdlambda,
 136                     bool bLR,int eNL);
 137
 138 #endif  /* _force_h */