include/filenm.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * check out http://www.gromacs.org for more information.
   7  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   8  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   9  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
  10  * directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38
  39 #ifndef _filenm_h
  40 #define _filenm_h
  41 #include "visibility.h"
  42 #include "futil.h"
  43
  44 #ifdef __cplusplus
  45 extern "C" {
  46 #endif
  47
  48 void set_default_file_name(const char *name);
  49 /* Set the default file name for all file types to name */
  50
  51 GMX_LIBGMX_EXPORT
  52 const char *ftp2ext(int ftp);
  53 /* Return extension for filetype */
  54
  55 const char *ftp2ext_generic(int ftp);
  56 /* Return extension for filetype, and a generic name for generic types
  57    (e.g. trx)*/
  58
  59 GMX_LIBGMX_EXPORT
  60 const char *ftp2desc(int ftp);
  61 /* Return description for file type */
  62
  63 const char *ftp2defnm(int ftp);
  64 /* Return default file name for file type */
  65
  66 const char *ftp2ftype(int ftp);
  67 /* Return Binary or ASCII depending on file type */
  68
  69 void pr_def(FILE *fp,int ftp);
  70 /* Print definitions for filename ftp */
  71
  72 void pr_defs(FILE *fp);
  73 /* Print definitions for all filename */
  74
  75 void pr_fns(FILE *fp,int nf,const t_filenm tfn[]);
  76 /* Print nf file names and types */
  77
  78 void pr_fopts(FILE *fp,int nf,const t_filenm tfn[], int shell);
  79 /* prints file options in tcsh 'complete' format */
  80
  81 void parse_file_args(int *argc,char *argv[],int nf,t_filenm fnm[],
  82                             gmx_bool bKeep, gmx_bool bReadNode);
  83 /* Parse command line for file names. When bKeep is set args are
  84  * not removed from argv. */
  85
  86 GMX_LIBGMX_EXPORT
  87 const char *opt2fn(const char *opt,int nfile, const t_filenm fnm[]);
  88 /* Return the filename belonging to cmd-line option opt, or NULL when
  89  * no such option. */
  90
  91 GMX_LIBGMX_EXPORT
  92 const char *opt2fn_master(const char *opt, int nfile,
  93                                 const t_filenm fnm[], t_commrec *cr);
  94 /* Return the filename belonging to cmd-line option opt, or NULL when
  95  * no such option or not running on master */
  96
  97
  98 GMX_LIBGMX_EXPORT
  99 int opt2fns(char **fns[], const char *opt,int nfile,
 100                    const t_filenm fnm[]);
 101 /* Return the filenames belonging to cmd-line option opt, or NULL when
 102  * no such option. */
 103
 104 #define opt2FILE(opt,nfile,fnm,mode) ffopen(opt2fn(opt,nfile,fnm),mode)
 105 /* Return a file pointer from the filename (see above) */
 106
 107 GMX_LIBGMX_EXPORT
 108 int fn2ftp(const char *fn);
 109 /* Return the filetype corrsponding to filename */
 110
 111 GMX_LIBGMX_EXPORT
 112 const char *ftp2fn(int ftp,int nfile,const t_filenm fnm[]);
 113 /* Return the first file name with type ftp, or NULL when none found. */
 114
 115 int ftp2fns(char **fns[], int ftp,int nfile,const t_filenm fnm[]);
 116 /* Return the number of files for the first option with type ftp
 117    and the files in **fns[] (will be allocated), or NULL when none found. */
 118
 119 #if 0
 120 /* This function is not thread-safe and used nowhere: */
 121 char *ftp2filter(int ftp);
 122 /* Return a file extension filter for file type */
 123 #endif
 124
 125 #define ftp2FILE(ftp,nfile,fnm,mode) ffopen(ftp2fn(ftp,nfile,fnm),mode)
 126 /* Return a file pointer from the filename (see above) */
 127
 128 GMX_LIBGMX_EXPORT
 129 gmx_bool ftp2bSet(int ftp,int nfile,const t_filenm fnm[]);
 130 /* Return TRUE when this file type has been found on the cmd-line */
 131
 132 GMX_LIBGMX_EXPORT
 133 gmx_bool opt2bSet(const char *opt,int nfile,const t_filenm fnm[]);
 134 /* Return TRUE when this option has been found on the cmd-line */
 135
 136 GMX_LIBGMX_EXPORT
 137 const char *opt2fn_null(const char *opt,int nfile,const t_filenm fnm[]);
 138 /* Return the filenm belonging top cmd-line option opt, or NULL when
 139  * no such option.
 140  * Also return NULL when opt is optional and option is not set.
 141  */
 142
 143 GMX_LIBGMX_EXPORT
 144 const char *ftp2fn_null(int ftp,int nfile,const t_filenm fnm[]);
 145 /* Return the first file name with type ftp, or NULL when none found.
 146  * Also return NULL when ftp is optional and option is not set.
 147  */
 148
 149 GMX_LIBGMX_EXPORT
 150 gmx_bool is_optional(const t_filenm *fnm);
 151 /* Return whether or not this filenm is optional */
 152
 153 GMX_LIBGMX_EXPORT
 154 gmx_bool is_output(const t_filenm *fnm);
 155 /* Return whether or not this filenm is output */
 156
 157 gmx_bool is_set(const t_filenm *fnm);
 158 /* Return whether or not this filenm is set */
 159
 160 /* When we do checkpointing, this routine is called to check for previous
 161  * output files and append a '.partNNNN' suffix before the (output) file extensions.
 162  */
 163 GMX_LIBGMX_EXPORT
 164 int add_suffix_to_output_names(t_filenm *fnm, int nfile, const char *suffix);
 165
 166 /* duplicate the filename list (to make a private copy for each thread,
 167    for example) */
 168 GMX_LIBGMX_EXPORT
 169 t_filenm *dup_tfn(int nf, const t_filenm tfn[]);
 170
 171 /* Free memory allocated for file names by parse_file_args(). */
 172 void done_filenms(int nf, t_filenm fnm[]);
 173
 174 #ifdef __cplusplus
 175 }
 176 #endif
 177
 178 #endif  /* _filenm_h */