include/domdec_network.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * This file is part of Gromacs        Copyright (c) 1991-2008
   5  * David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, University of Groningen.
   6  * Copyright (c) 2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   7  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   8  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
   9  * directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef _domdec_network_h
  39 #define _domdec_network_h
  40 #include "visibility.h"
  41 #include "typedefs.h"
  42 #include "types/commrec.h"
  43
  44 #ifdef __cplusplus
  45 extern "C" {
  46 #endif
  47
  48 enum {
  49     dddirForward, dddirBackward
  50 };
  51
  52 /* Move integers in the comm. region one cell along the domain decomposition
  53  * in the dimension indexed by ddimind
  54  * forward (direction=dddirFoward) or backward (direction=dddirBackward).
  55  */
  56 void
  57 dd_sendrecv_int(const gmx_domdec_t *dd,
  58                 int ddimind, int direction,
  59                 int *buf_s, int n_s,
  60                 int *buf_r, int n_r);
  61
  62 /* Move reals in the comm. region one cell along the domain decomposition
  63  * in the dimension indexed by ddimind
  64  * forward (direction=dddirFoward) or backward (direction=dddirBackward).
  65  */
  66 void
  67 dd_sendrecv_real(const gmx_domdec_t *dd,
  68                  int ddimind, int direction,
  69                  real *buf_s, int n_s,
  70                  real *buf_r, int n_r);
  71
  72 /* Move revc's in the comm. region one cell along the domain decomposition
  73  * in dimension indexed by ddimind
  74  * forward (direction=dddirFoward) or backward (direction=dddirBackward).
  75  */
  76 void
  77 dd_sendrecv_rvec(const gmx_domdec_t *dd,
  78                  int ddimind, int direction,
  79                  rvec *buf_s, int n_s,
  80                  rvec *buf_r, int n_r);
  81
  82
  83 /* Move revc's in the comm. region one cell along the domain decomposition
  84  * in dimension indexed by ddimind
  85  * simultaneously in the forward and backward directions.
  86  */
  87 void
  88 dd_sendrecv2_rvec(const gmx_domdec_t *dd,
  89                   int ddimind,
  90                   rvec *buf_s_fw, int n_s_fw,
  91                   rvec *buf_r_fw, int n_r_fw,
  92                   rvec *buf_s_bw, int n_s_bw,
  93                   rvec *buf_r_bw, int n_r_bw);
  94
  95
  96 /* The functions below perform the same operations as the MPI functions
  97  * with the same name appendices, but over the domain decomposition
  98  * nodes only.
  99  * The DD master node is the master for these operations.
 100  */
 101
 102 GMX_LIBMD_EXPORT
 103 void
 104 dd_bcast(gmx_domdec_t *dd, int nbytes, void *data);
 105
 106 /* Copies src to dest on the master node and then broadcasts */
 107 void
 108 dd_bcastc(gmx_domdec_t *dd, int nbytes, void *src, void *dest);
 109
 110 void
 111 dd_scatter(gmx_domdec_t *dd, int nbytes, void *src, void *dest);
 112
 113 void
 114 dd_gather(gmx_domdec_t *dd, int nbytes, void *src, void *dest);
 115
 116 /* If rcount==0, rbuf is allowed to be NULL */
 117 void
 118 dd_scatterv(gmx_domdec_t *dd,
 119             int *scounts, int *disps, void *sbuf,
 120             int rcount, void *rbuf);
 121
 122 /* If scount==0, sbuf is allowed to be NULL */
 123 void
 124 dd_gatherv(gmx_domdec_t *dd,
 125            int scount, void *sbuf,
 126            int *rcounts, int *disps, void *rbuf);
 127
 128 #ifdef __cplusplus
 129 }
 130 #endif
 131
 132 #endif  /* _domdec_network_h */