docs/release-notes/2022/major/features.rst

   1 New and improved features
   2 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
   3
   4 .. Note to developers!
   5    Please use """"""" to underline the individual entries for fixed issues in the subfolders,
   6    otherwise the formatting on the webpage is messed up.
   7    Also, please use the syntax :issue:`number` to reference issues on GitLab, without the
   8    a space between the colon and number!
   9
  10
  11 Transformation pull coordinate for mathematical transformations of pull coordinates
  12 """""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  13
  14 A new pull coordinate type named transformation has been added. This enables mathematical
  15 transformation of previously defined pull coordinates using a user supplied formula
  16 in a string. This allows for example non-linear transformation of a distance, e.g.
  17 a contact coordinate or (non-)linear combinations of multiple pull coordinates.
  18 This is a powerful tool for defining complex reaction coordinates and it can be combined
  19 with the Accelerated Weight Histogram Method to enhance sampling.
  20
  21 Replica-exchange molecular dynamics simulations with GPU update
  22 """""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  23
  24 Replica-exchange molecular dynamics now works with GPU update.