docs/release-notes/2021/2021.2.rst

   1 GROMACS 2021.2 release notes
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   4 This version was released on TODO, 2021. These release notes
   5 document the changes that have taken place in GROMACS since the
   6 previous 2021.1 version, to fix known issues. It also incorporates all
   7 fixes made in version 2020.6 and earlier, which you can find described
   8 in the :ref:`release-notes`.
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  10 .. Note to developers!
  11    Please use """"""" to underline the individual entries for fixed issues in the subfolders,
  12    otherwise the formatting on the webpage is messed up.
  13    Also, please use the syntax :issue:`number` to reference issues on GitLab, without the
  14    a space between the colon and number!
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  16 Fixes where mdrun could behave incorrectly
  17 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  18
  19 Removed a potential race condition with GPU update
  20 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  21
  22 Fixed possible (but so far unobserved) race condition in coordinate copy when
  23 using GPU update with dipole moment calculation.
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  25 :issue:`4024`
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  27 Fixes for ``gmx`` tools
  28 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  29
  30 Fix grompp check for position restraints with absolute reference
  31 """"""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  32
  33 Fixed that grompp with position restraints would always issue a warning about
  34 using an absolute reference, even when an absolute reference was not used.
  35
  36 :issue:`3996`
  37
  38 Fix error when using VMD plugin
  39 """""""""""""""""""""""""""""""
  40
  41 Tools would crash with a C++ library assertion because the plugin loading
  42 code incorrectly tried to construct a string from nullptr.
  43
  44 :issue:`3055`
  45
  46 Fixes that affect portability
  47 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  48
  49 Support for Intel oneAPI compiler 2021.2
  50 """""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  51
  52 Fixed compiler infinity math and MKL flags.
  53
  54 Fix Apple OpenCL build
  55 """"""""""""""""""""""
  56
  57 :issue:`4008`
  58
  59 Miscellaneous
  60 ^^^^^^^^^^^^^
  61
  62 Fix bond type in GROMOS force fields
  63 """"""""""""""""""""""""""""""""""""
  64
  65 The bond type for C and +N in [ACE] was incorrect.
  66
  67 :issue:`3995`