docs/release-notes/2020/2020.6.rst

   1 GROMACS 2020.6 release notes
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   4 This version was released on TODO, 2021. These release notes
   5 document the changes that have taken place in GROMACS since the
   6 previous 2020.5 version, to fix known issues.
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   8 .. Note to developers!
   9    Please use """"""" to underline the individual entries for fixed issues in the subfolders,
  10    otherwise the formatting on the webpage is messed up.
  11    Also, please use the syntax :issue:`number` to reference issues on redmine, without the
  12    a space between the colon and number!
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  14 Fixes where mdrun could behave incorrectly
  15 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
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  17 Cosine acceleration failed to abort if it could not be run
  18 """"""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
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  20 Cosine acceleration is only compatible with the leap-frog
  21 integrator (mdp option `integrator = md`). Gromacs did, however,
  22 accept input files requesting cosine acceleration for other
  23 integration algorithms, and did report viscosity-related
  24 quantities from these simulations. Since the cosine acceleration
  25 was never applied in these cases, any results obtained from
  26 simulations with enabled cosine acceleration and integrators
  27 other than `md` should be regarded as invalid.
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  29 :issue:`3903`
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  31 Fixes for ``gmx`` tools
  32 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  33
  34 Fix range checking bug in ``gmx covar``
  35 """""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  36
  37 A check was inverted causing range checking to be applied wrong.
  38
  39 :issue:`3902`
  40
  41 Fixes that affect portability
  42 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
  43
  44 Miscellaneous
  45 ^^^^^^^^^^^^^