docs/reference-manual/looking-at-trajectory.rst

   1 Looking at your trajectory
   2 --------------------------
   3
   4 .. _fig-ngmxdump:
   5
   6 .. figure:: plots/ngmxdump.*
   7    :width: 8.00000cm
   8
   9    The window of :ref:`gmx view <gmx view>` showing a box of water.
  10
  11 | :ref:`gmx view <gmx view>`
  12 | Before analyzing your trajectory it is often informative to look at
  13   your trajectory first. |Gromacs| comes with a simple trajectory viewer
  14   :ref:`gmx view <gmx view>`; the advantage
  15   with this one is that it does not require OpenGL, which usually isn’t
  16   present on *e.g.* supercomputers. It is also possible to generate a
  17   hard-copy in Encapsulated Postscript format (see
  18   :numref:`Fig. %s <fig-ngmxdump>`). If you want a faster and more
  19   fancy viewer there are several programs that can read the |Gromacs|
  20   trajectory formats – have a look at our `webpage`_ for updated links.
  21