docs/doxygen/cycle-suppressions.txt

   1 # Order (or more generally, edge selection) is significant (see gmxtree.md);
   2 # "moduleA -> moduleB" means that moduleA should not depend on moduleB, and is
   3 # a problem to be addressed at some point.
   4
   5 domdec -> imd
   6 domdec -> ewald
   7 domdec -> mdlib
   8 domdec -> pulling
   9 fileio -> gmxlib
  10 mdlib -> essentialdynamics
  11 mdlib -> imd
  12 mdlib -> ewald
  13 mdlib -> pulling
  14 nbnxm -> domdec
  15 nbnxm -> mdlib
  16 simd -> hardware
  17 gpu_utils -> hardware
  18 listed_forces -> mdlib
  19 utility -> math
  20
  21 # modular simulator uses shellfc from mdrun, but is later included in mdrun by simulator builder
  22 modularsimulator -> mdrun
  23
  24 # Cycle counters in timing use comrec for the set up, which is in the mdtypes. This introduces
  25 # cyclic dependencies if the cycle counting is used anywhere in mdtypes.
  26 timing -> mdtypes
  27
  28 # awh has dependencies in mdlib and pulling that need resolving.
  29 mdlib -> applied_forces