cmake/legacy_and_external.supp

   1 # This suppression file is used to run the CTest Unit Tests
   2 # All problems in external libraries are excluded
   3 # Memory leaks in the legacy code are excluded
   4 # Other problems besides memory leaks should NOT be excluded for legacy code
   5
   6 {
   7    libz
   8    Memcheck:Cond
   9    fun:inflateReset2
  10    fun:inflateInit2_
  11 }
  12
  13 # OpenMPI
  14 {
  15    MPI_Init/Leak
  16    Memcheck:Leak
  17    ...
  18    fun:PMPI_Init
  19 }
  20 {
  21    MPI_Finalize/Leak
  22    Memcheck:Leak
  23    fun:malloc
  24    fun:ompi_proc_all
  25    ...
  26    fun:_ZN3gmx8finalizeEv
  27 }
  28 {
  29    MPI_Init/Addr4
  30    Memcheck:Addr4
  31    ...
  32    fun:PMPI_Init
  33 }
  34 {
  35    MPI_Init/sched_setaffinity
  36    Memcheck:Param
  37    sched_setaffinity(mask)
  38    ...
  39    fun:PMPI_Init
  40 }
  41 {
  42    MPI_Init/writev
  43    Memcheck:Param
  44    writev(vector[...])
  45    ...
  46    fun:PMPI_Init
  47 }
  48
  49 {
  50    gmx_fio_fopen
  51    Memcheck:Leak
  52    ...
  53    fun:gmx_fio_fopen
  54 }
  55 {
  56    new_symbuf
  57    Memcheck:Leak
  58    ...
  59    fun:new_symbuf
  60 }
  61 {
  62    bTimeSet/tMPI_Thread_mutex_init_once
  63    Memcheck:Leak
  64    ...
  65    fun:tMPI_Thread_mutex_init_once
  66    fun:tMPI_Thread_mutex_lock
  67    fun:bTimeSet
  68 }
  69 {
  70    ffclose/tMPI_Thread_mutex_init_once
  71    Memcheck:Leak
  72    ...
  73    fun:tMPI_Thread_mutex_init_once
  74    fun:tMPI_Thread_mutex_lock
  75    fun:ffclose
  76 }
  77
  78 {
  79    mdrun
  80    Memcheck:Leak
  81    ...
  82    obj:*/mdrun*
  83 }
  84
  85 {
  86    strdup/strtod
  87    Memcheck:Addr8
  88    fun:__GI___strncasecmp_l
  89    fun:____strtod_l_internal
  90 }
  91
  92
  93 #MacOS rules
  94 {
  95    dyld_register_image_state_change_handler
  96    Memcheck:Leak
  97    fun:malloc
  98    fun:malloc
  99    ...
 100    fun:dyld_register_image_state_change_handler
 101 }
 102
 103 {
 104    __emutls_get_address
 105    Memcheck:Leak
 106    ...
 107    fun:__emutls_get_address
 108 }
 109
 110 {
 111    libSystem_initializer
 112    Memcheck:Leak
 113    ...
 114    fun:libSystem_initializer
 115 }
 116
 117 {
 118    atexit
 119    Memcheck:Leak
 120    fun:malloc
 121    fun:atexit_register
 122 }
 123
 124 {
 125    unw_set_reg
 126    Memcheck:Leak
 127    ...
 128    fun:unw_set_reg
 129    fun:__gxx_personality_v0
 130 }
 131
 132 {
 133    printf
 134    Memcheck:Leak
 135    fun:malloc
 136    ...
 137    fun:__vfprintf
 138 }
 139
 140 {
 141    strtof
 142    Memcheck:Leak
 143    fun:malloc
 144    ...
 145    fun:strtof_l
 146 }
 147
 148 {
 149    scanf
 150    Memcheck:Leak
 151    ...
 152    fun:__svfscanf_l
 153 }
 154
 155 {
 156     localtime
 157     Memcheck:Leak
 158     ...
 159     fun:localtime
 160 }
 161
 162 {
 163    __cxa_get_globals
 164    Memcheck:Leak
 165    fun:malloc
 166    fun:__cxa_get_globals
 167 }
 168 {
 169    __cxa_get_globals
 170    Memcheck:Leak
 171    fun:calloc
 172    fun:__cxa_get_globals
 173    fun:__cxa_throw
 174 }
 175
 176 {
 177    _Unwind_RaiseException
 178    Memcheck:Leak
 179    fun:malloc
 180    ...
 181    fun:_Unwind_RaiseException
 182    fun:__cxa_throw
 183 }
 184 {
 185    posix_memalign
 186    Memcheck:Leak
 187    ...
 188    fun:posix_memalign
 189 }
 190
 191 # Intel compiler on MacOS
 192 {
 193    __cilkrts_os_mutex_create
 194    Memcheck:Leak
 195    fun:malloc
 196    fun:__cilkrts_os_mutex_create
 197 }
 198 # Intel compiler with MKL
 199 {
 200    dlerror
 201    Memcheck:Leak
 202    ...
 203    fun:_dlerror_run
 204 }
 205 #Intel
 206 {
 207    strlen
 208    Memcheck:Addr8
 209    fun:__intel_sse2_strlen
 210 }
 211 {
 212    strlen2
 213    Memcheck:Cond
 214    fun:__intel_sse2_strlen
 215 }
 216 {
 217    __kmpc_global_thread_num
 218    Memcheck:Param
 219    sched_setaffinity(mask)
 220    ...
 221    fun:__kmpc_global_thread_num
 222 }
 223 {
 224    __kmpc_global_thread_num2
 225    Memcheck:Cond
 226    ...
 227    fun:__kmpc_global_thread_num
 228 }
 229 {
 230    __kmpc_global_thread_num3
 231    Memcheck:Leak
 232    ...
 233    fun:__kmpc_global_thread_num
 234 }