api/nblib/listed_forces/tests/conversions.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2020,2021, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * This implements basic nblib utility tests
  38  *
  39  * \author Victor Holanda <victor.holanda@cscs.ch>
  40  * \author Joe Jordan <ejjordan@kth.se>
  41  * \author Prashanth Kanduri <kanduri@cscs.ch>
  42  * \author Sebastian Keller <keller@cscs.ch>
  43  */
  44 #include <numeric>
  45
  46 #include <gtest/gtest.h>
  47
  48 #include "nblib/listed_forces/conversions.hpp"
  49
  50 #include "testutils/testasserts.h"
  51
  52
  53 namespace nblib
  54 {
  55 namespace test
  56 {
  57 namespace
  58 {
  59
  60 ListedInteractionData someBondsAndAngles()
  61 {
  62     ListedInteractionData         interactions;
  63     HarmonicBondType              bond1{ 10, 0.1 };
  64     HarmonicBondType              bond2{ 20, 0.2 };
  65     std::vector<HarmonicBondType> bonds{ bond1, bond2 };
  66     pickType<HarmonicBondType>(interactions).parameters = bonds;
  67
  68     HarmonicAngle              angle1(100, Degrees(100));
  69     HarmonicAngle              angle2(200, Degrees(101));
  70     std::vector<HarmonicAngle> angles{ angle1, angle2 };
  71     pickType<HarmonicAngle>(interactions).parameters = angles;
  72
  73     std::vector<InteractionIndex<HarmonicBondType>> bondIndices{ { 0, 1, 0 }, { 1, 2, 0 }, { 2, 3, 1 } };
  74     pickType<HarmonicBondType>(interactions).indices = std::move(bondIndices);
  75
  76     std::vector<InteractionIndex<HarmonicAngle>> angleIndices{ { 0, 1, 2, 0 }, { 1, 2, 3, 1 } };
  77     pickType<HarmonicAngle>(interactions).indices = std::move(angleIndices);
  78
  79     return interactions;
  80 }
  81
  82 TEST(ListedShims, ParameterConversion)
  83 {
  84     ListedInteractionData interactions = someBondsAndAngles();
  85
  86     auto [idef, gmx_params] = createFFparams(interactions);
  87
  88     EXPECT_EQ(gmx_params->iparams.size(), 4);
  89     EXPECT_EQ(gmx_params->iparams[0].harmonic.rA,
  90               pickType<HarmonicBondType>(interactions).parameters[0].equilConstant());
  91     EXPECT_REAL_EQ_TOL(gmx_params->iparams[2].harmonic.rA,
  92                        pickType<HarmonicAngle>(interactions).parameters[0].equilConstant() / DEG2RAD,
  93                        gmx::test::defaultRealTolerance());
  94
  95     EXPECT_EQ(idef->il[F_BONDS].iatoms.size(), 9);
  96     std::vector<int> bondIatoms{ 0, 0, 1, 0, 1, 2, 1, 2, 3 };
  97     EXPECT_EQ(idef->il[F_BONDS].iatoms, bondIatoms);
  98     std::vector<int> angleIatoms{ 2, 0, 1, 2, 3, 1, 2, 3 };
  99     EXPECT_EQ(idef->il[F_ANGLES].iatoms, angleIatoms);
 100     idef->clear();
 101 }
 102
 103 } // namespace
 104 } // namespace test
 105 } // namespace nblib