admin/gromacs.spec

   1 #
   2 # RPM specification file to make normal gromacs packages (without mpi)
   3 # If you have mpi installed, you can create an mpi mdrun executable
   4 # and libs with the gromacs-mpi spec file!
   5
   6 #
   7 # Main package - only dynamic libs, and no header files
   8 #
   9 Summary: Molecular dynamics package (non-parallel)
  10 Name: gromacs
  11 Version: 3.0
  12 Release: 1
  13 Copyright: GPL
  14 Group: Applications/Science
  15 Prefix: /usr/local/gromacs
  16 Requires: fftw >= 2.1.3
  17 Source: ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/source/gromacs-%{version}.tar.gz
  18 URL: http://www.gromacs.org
  19 Packager: Erik Lindahl <lindahl@gromacs.org>
  20 %description
  21 GROMACS is a versatile and extremely well optimized package
  22 to perform molecular dynamics computer simulations and
  23 subsequent trajectory analysis. It is developed for
  24 biomolecules like proteins, but the extremely high
  25 performance means it is used also in several other field
  26 like polymer chemistry and solid state physics. This
  27 version has the dynamic libs and executables; to hack new
  28 utility programs you also need the headers and static
  29 libs in gromacs-dev. Linux kernel 2.4 or later is STRONGLY
  30 recommended on Pentium III and later processors since
  31 GROMACS then can use assembly loops with SSE instructions.
  32
  33 #
  34 # The header files and static libraries go into gromacs-devel...
  35 #
  36 %package devel
  37 Summary: Header files and static libraries for GROMACS
  38 Group: Applications/Science
  39 Prefix: %{prefix}
  40 Requires: fftw-devel >=2.1.3, gromacs = %{version}-%{release}
  41 %description devel
  42 This package contains header files, static libraries,
  43 and a program example for the GROMACS molecular
  44 dynamics software. You need it if you want to write your
  45 own analysis programs. A word of warning, though;
  46 this package is still somewhat untidy, and might put a
  47 lot of files in your standard include dir if you change
  48 the default prefix!
  49
  50 %prep
  51 %setup
  52
  53 %build
  54 # We can actually install in /usr/local/bin, /usr/local/lib, etc,  by using the options
  55 # --prefix=/usr/local, --exec-prefix=/usr/local  and --datadir=/usr/local/share/gromacs,
  56 # but since the development package puts a lot of include files in {prefix}/include we
  57 # default to /usr/local/gromacs. Will try to fix that in gromacs 4.0 :-)
  58
  59 ./configure
  60 make
  61
  62 %install
  63 make DESTDIR=${RPM_BUILD_ROOT} install
  64 # Move mdrun to mdrun_nompi - we make a link at post-install script time!
  65 (cd ${RPM_BUILD_ROOT}%{prefix}/%{_target}/bin && mv mdrun mdrun_nompi)
  66
  67 %clean
  68 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}
  69
  70 %post
  71 #
  72 # Add our (final) library directory to /etc/ld.so.conf if it is not already there
  73 #
  74 if test -z `grep ${RPM_INSTALL_PREFIX}/%{_target}/lib /etc/ld.so.conf`; then
  75      cat >> /etc/ld.so.conf < ${RPM_INSTALL_PREFIX}/%{_target}/lib
  76 fi
  77 # Make a link from mdrun_nompi to mdrun - if it doesn't already exist!
  78 (cd ${RPM_INSTALL_PREFIX}/%{_target}/bin && test ! -e mdrun && ln -s mdrun_nompi mdrun)
  79
  80 # run ldconfig to update the runtime linker database with the new libraries
  81 # (make sure /sbin is in the $PATH)
  82 PATH="/sbin:$PATH" ldconfig
  83
  84 %postun
  85 # after uninstall, run ldconfig to remove the libs from the linker database
  86 PATH="/sbin:$PATH" ldconfig
  87 # and remove the link from mdrun_nompi to mdrun
  88 (cd ${RPM_INSTALL_PREFIX}/%{_target}/bin && rm -f mdrun)
  89
  90 %files
  91 %defattr(-,root,root)
  92 %doc /usr/local/gromacs/README
  93 /usr/local/gromacs/%{_target}/bin/*
  94 /usr/local/gromacs/share/top/*
  95 /usr/local/gromacs/share/tutor/*
  96 %docdir /usr/local/gromacs/share/html
  97 /usr/local/share/gromacs/html/
  98 %docdir /usr/local/gromacs/man
  99 /usr/local/gromacs/man/*
 100 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx.so.1.0.0
 101 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx.so.1
 102 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd.so.1.0.0
 103 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd.so.1
 104 %files devel
 105 %defattr(-,root,root)
 106 /usr/local/gromacs/share/template/*
 107 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx.so
 108 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx.a
 109 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx.la
 110 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd.so
 111 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd.a
 112 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd.la
 113 /usr/local/gromacs/include/*