admin/gromacs-mpi.spec

   1 #
   2 # RPM specification file to make gromacs-mpi mdrun executable,
   3 # and libraries. For the rest, use the gromacs (non-mpi) spec file.
   4
   5 #
   6 # Main package - only dynamic libs, and no header files
   7 #
   8 Summary: Molecular dynamics package (parallel)
   9 Name: gromacs-mpi
  10 Version: 3.0
  11 Release: 1
  12 Copyright: GPL
  13 Group: Applications/Science
  14 Prefix: /usr/local/gromacs
  15 Requires: fftw-lammpi >=2.1.3 , lam = 6.5.2, gromacs = %{version}-%{release}
  16 Source: ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/source/gromacs-%{version}.tar.gz
  17 URL: http://www.gromacs.org
  18 Packager: Erik Lindahl <lindahl@gromacs.org>
  19 %description
  20 This is the MPI support files and mdrun executable of GROMACS,
  21 a versatile and extremely well optimized package
  22 to perform molecular dynamics computer simulations and
  23 subsequent trajectory analysis. All auxiliary programs
  24 and data files are located in the gromacs (non-mpi) package.
  25
  26 #
  27 # The header files and static libraries go into gromacs-mpi-devel...
  28 #
  29 %package devel
  30 Summary: Header files and static libs for parallel GROMACS
  31 Group: Applications/Science
  32 Prefix: %{prefix}
  33 Requires: fftw-lammpi >=2.1.3, fftw-lammpi-devel >=2.1.3, lam = 6.5.2, gromacs-%{version}-%{release}, gromacs-devel-%{version}-%{release}, gromacs-mpi-%{version}-%{release}
  34 %description devel
  35 This package contains the static libraries for
  36 the parallel GROMACS development. You will only need
  37 it if you are hacking parallel mdrun stuff, and then
  38 you probably want the full source anyway...
  39
  40 %prep
  41 %setup
  42
  43 %build
  44 # Call it mdrun_mpi
  45 ./configure --program_suffix="_mpi"
  46 make mdrun
  47
  48 %install
  49 make DESTDIR=${RPM_BUILD_ROOT} install-mdrun
  50
  51 %clean
  52 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}
  53
  54 %post
  55 # /etc/ld.so.conf should have been updated by the normal gromacs package.
  56 # Overwrite the mdrun link - it should point to mdrun_mpi iso mdrun_nompi now!
  57 (cd ${RPM_INSTALL_PREFIX}/%{_target}/bin && ln -sf mdrun_mpi mdrun)
  58
  59
  60 %postun
  61 # If we removed the gromacs-mpi package, while the non-mpi version is still present,
  62 # we should restore the mdrun link:
  63 (cd ${RPM_INSTALL_PREFIX}/%{_target}/bin && test ! -e mdrun && ln -s mdrun_nompi mdrun)
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  65 %files
  66 %defattr(-,root,root)
  67 /usr/local/gromacs/%{_target}/bin/*
  68 /usr/local/gromacs/share/top/*
  69 /usr/local/gromacs/share/tutor/*
  70 %docdir /usr/local/gromacs/share/html
  71 /usr/local/gromacs/share/html/*
  72 %docdir /usr/local/gromacs/man
  73 /usr/local/gromacs/man/*
  74 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx_mpi.so.1.0.0
  75 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx_mpi.so.1
  76 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd_mpi.so.1.0.0
  77 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd_mpi.so.1
  78 %files devel
  79 %defattr(-,root,root)
  80 /usr/local/gromacs/share/template/*
  81 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx_mpi.so
  82 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx_mpi.a
  83 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libgmx_mpi.la
  84 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd_mpi.so
  85 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd_mpi.a
  86 /usr/local/gromacs/%{_target}/lib/libmd_mpi.la
  87 /usr/local/gromacs/include/*