admin/gitlab-ci/python-gmxapi.gitlab-ci.yml

   1 #
   2 # Jobs to test gmxapi client (Python) packages
   3 #
   4
   5 # Base job definition for gmxapi 0.1 tests against GROMACS 2020 in clang-8 environments.
   6 .gmxapi-0.1:clang-8:
   7   extends:
   8     - .variables:default
   9     - .use-clang8
  10   stage: test
  11   variables:
  12     PY_UNIT_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/py-JUnitTestResults.xml
  13     PY_MPI_UNIT_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/py-mpi-JUnitTestResults.xml
  14     PY_ACCEPTANCE_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/gmxapi-acceptance-JUnitTestResults.xml
  15     PY_MPI_ACCEPTANCE_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/gmxapi-acceptance-mpi-JUnitTestResults.xml
  16     EXTRA_INSTALLS: "curl libbz2-dev libffi-dev liblzma-dev libncurses5-dev libncursesw5-dev libreadline-dev libsqlite3-dev libssl-dev llvm python-openssl tk-dev zlib1g-dev"
  17   script:
  18     - source $INSTALL_DIR/bin/GMXRC
  19     - source $VENVPATH/bin/activate && INSTALL_DIR=$PWD/$INSTALL_DIR bash -x admin/ci-scripts/build-and-test-py-gmxapi-0.1.sh
  20   artifacts:
  21     reports:
  22       junit:
  23         - $PY_UNIT_TEST_XML
  24         - $PY_MPI_UNIT_TEST_XML
  25         - $PY_ACCEPTANCE_TEST_XML
  26         - $PY_MPI_ACCEPTANCE_TEST_XML
  27     when: always
  28     expire_in: 1 week
  29   needs:
  30     - job: gromacs:clang-8:build
  31       artifacts: true
  32
  33 gmxapi-0.1:clang-8:py-3.5.9:
  34   extends:
  35     - .gmxapi-0.1:clang-8
  36   rules:
  37     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
  38       when: never
  39     # Allow explicit trigger through web interface.
  40     - if: '$GMX_GMXAPI_0_1'
  41       when: always
  42     - if: '$GROMACS_RELEASE'
  43       when: never
  44     # Run this job for release-2020 branch and merge-requests targeting it.
  45     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "release-2020" || $CI_COMMIT_BRANCH == "release-2020"'
  46       when: always
  47   variables:
  48     VENVPATH: "/root/venv/py3.5"
  49     PY_VER: "3.5.9"
  50
  51 gmxapi-0.1:clang-8:py-3.6.10:
  52   extends:
  53     - .gmxapi-0.1:clang-8
  54   rules:
  55     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
  56       when: never
  57     # Allow explicit trigger through web interface.
  58     - if: '$GMX_GMXAPI_0_1'
  59       when: always
  60     - if: '$GROMACS_RELEASE'
  61       when: never
  62     # Run this job for release-2020 branch and merge-requests targeting it.
  63     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "release-2020" || $CI_COMMIT_BRANCH == "release-2020"'
  64       when: always
  65   variables:
  66     VENVPATH: "/root/venv/py3.6"
  67     PY_VER: "3.6.10"
  68
  69 gmxapi-0.1:clang-8:py-3.7.7:
  70   extends:
  71     - .gmxapi-0.1:clang-8
  72   rules:
  73     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
  74       when: never
  75     # Allow explicit trigger through web interface.
  76     - if: '$GMX_GMXAPI_0_1'
  77       when: always
  78     - if: '$GROMACS_RELEASE'
  79       when: never
  80     # Run this job for release-2020 branch and merge-requests targeting it.
  81     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "release-2020" || $CI_COMMIT_BRANCH == "release-2020"'
  82       when: always
  83   variables:
  84     VENVPATH: "/root/venv/py3.7"
  85     PY_VER: "3.7.7"
  86
  87 gmxapi-0.1:clang-8:py-3.8.2:
  88   extends:
  89     - .gmxapi-0.1:clang-8
  90   rules:
  91     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
  92       when: never
  93     # Allow explicit trigger through web interface.
  94     - if: '$GMX_GMXAPI_0_1'
  95       when: always
  96     - if: '$GROMACS_RELEASE'
  97       when: never
  98     # Run this job for release-2020 branch and merge-requests targeting it.
  99     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "release-2020" || $CI_COMMIT_BRANCH == "release-2020"'
 100       when: always
 101   variables:
 102     VENVPATH: "/root/venv/py3.8"
 103     PY_VER: "3.8.2"
 104
 105 # Base job definition for gmxapi 0.2 tests against GROMACS 2021 in clang-8 environments.
 106 .gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021:
 107   extends:
 108     - .variables:default
 109     - .use-clang8
 110   rules:
 111     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
 112       when: never
 113     # Allow explicit trigger through web interface.
 114     - if: '$GMX_GMXAPI_0_2'
 115       when: always
 116     - if: '$GROMACS_RELEASE'
 117       when: never
 118     # Run this job for master branch and merge-requests targeting it.
 119     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "master" || $CI_COMMIT_BRANCH == "master"'
 120       when: always
 121   stage: test
 122   variables:
 123     PY_UNIT_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/py-JUnitTestResults.xml
 124     PY_MPI_UNIT_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/py-mpi-JUnitTestResults.xml
 125     PY_ACCEPTANCE_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/gmxapi-acceptance-JUnitTestResults.xml
 126     PY_MPI_ACCEPTANCE_TEST_XML: $CI_PROJECT_DIR/gmxapi-acceptance-mpi-JUnitTestResults.xml
 127   script:
 128     - source $INSTALL_DIR/bin/GMXRC
 129     - source $VENVPATH/bin/activate && INSTALL_DIR=$PWD/$INSTALL_DIR bash -x admin/ci-scripts/build-and-test-py-gmxapi-0.2.sh
 130   artifacts:
 131     reports:
 132       junit:
 133         - $PY_UNIT_TEST_XML
 134         - $PY_MPI_UNIT_TEST_XML
 135         - $PY_ACCEPTANCE_TEST_XML
 136         - $PY_MPI_ACCEPTANCE_TEST_XML
 137     when: always
 138     expire_in: 1 week
 139   needs:
 140     - job: gromacs:clang-8:build
 141       artifacts: true
 142
 143 gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021:py-3.6.10:
 144   extends:
 145     - .gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021
 146   rules:
 147     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
 148       when: never
 149     # Allow explicit trigger through web interface.
 150     - if: '$GMX_GMXAPI_0_2'
 151       when: always
 152     - if: '$GROMACS_RELEASE'
 153       when: never
 154     # Run this job for master branch and merge-requests targeting it.
 155     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "master" || $CI_COMMIT_BRANCH == "master"'
 156       when: always
 157   variables:
 158     VENVPATH: "/root/venv/py3.6"
 159     PY_VER: "3.6.10"
 160
 161 gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021:py-3.7.7:
 162   extends:
 163     - .gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021
 164   rules:
 165     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
 166       when: never
 167     # Allow explicit trigger through web interface.
 168     - if: '$GMX_GMXAPI_0_2'
 169       when: always
 170     - if: '$GROMACS_RELEASE'
 171       when: never
 172     # Run this job for master branch and merge-requests targeting it.
 173     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "master" || $CI_COMMIT_BRANCH == "master"'
 174       when: always
 175   variables:
 176     VENVPATH: "/root/venv/py3.7"
 177     PY_VER: "3.7.7"
 178
 179 gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021:py-3.8.2:
 180   extends:
 181     - .gmxapi-0.2:clang-8:gmx2021
 182   rules:
 183     - if: '$CI_PROJECT_NAMESPACE != "gromacs"'
 184       when: never
 185     # Allow explicit trigger through web interface.
 186     - if: '$GMX_GMXAPI_0_2'
 187       when: always
 188     - if: '$GROMACS_RELEASE'
 189       when: never
 190     # Run this job for master branch and merge-requests targeting it.
 191     - if: '$CI_MERGE_REQUEST_TARGET_BRANCH_NAME == "master" || $CI_COMMIT_BRANCH == "master"'
 192       when: always
 193   variables:
 194     VENVPATH: "/root/venv/py3.8"
 195     PY_VER: "3.8.2"