Merge "[tools] g_sans - add trajectory avereging"
[alexxy/gromacs.git] / COPYING-OTHER
1 GROMACS is free software, distributed under the GNU General Public License. 
2 See COPING for details. It however includes optional code covered by several 
3 different licences as described below.
4
5
6 1. Trajectory file reading using VMD plugins 
7    Files: src/external/vmd_molfile/*
8           src/gromacs/gmxlib/vmdio.c
9
10                 (C) Copyright 1995-2009 The Board of Trustees of the
11                             University of Illinois
12                              All Rights Reserved
13
14 Developed by:           Theoretical and Computational Biophysics Group
15                         University of Illinois at Urbana-Champaign
16                         http://www.ks.uiuc.edu/
17
18 Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of
19 this software and associated documentation files (the Software), to deal with
20 the Software without restriction, including without limitation the rights to
21 use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell copies
22 of the Software, and to permit persons to whom the Software is furnished to
23 do so, subject to the following conditions:
24
25 Redistributions of source code must retain the above copyright notice,
26 this list of conditions and the following disclaimers.
27
28 Redistributions in binary form must reproduce the above copyright notice,
29 this list of conditions and the following disclaimers in the documentation
30 and/or other materials provided with the distribution.
31
32 Neither the names of Theoretical and Computational Biophysics Group,
33 University of Illinois at Urbana-Champaign, nor the names of its contributors
34 may be used to endorse or promote products derived from this Software without
35 specific prior written permission.
36
37 THE SOFTWARE IS PROVIDED AS IS, WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
38 IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
39 FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT.  IN NO EVENT SHALL
40 THE CONTRIBUTORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR
41 OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE,
42 ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR
43 OTHER DEALINGS WITH THE SOFTWARE.
44
45 2. Internal FFT
46    Files: src/external/fftpack/fftpack.c
47
48 Copyright (c) 2005-2011, NumPy Developers.
49 All rights reserved.
50
51 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
52 modification, are permitted provided that the following conditions are
53 met:
54
55     * Redistributions of source code must retain the above copyright
56        notice, this list of conditions and the following disclaimer.
57
58     * Redistributions in binary form must reproduce the above
59        copyright notice, this list of conditions and the following
60        disclaimer in the documentation and/or other materials provided
61        with the distribution.
62
63     * Neither the name of the NumPy Developers nor the names of any
64        contributors may be used to endorse or promote products derived
65        from this software without specific prior written permission.
66
67 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
68 "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
69 LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
70 A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT
71 OWNER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
72 SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
73 LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
74 DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
75 THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
76 (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
77 OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
78
79 fftpack.c : A set of FFT routines in C.
80 Algorithmically based on Fortran-77 FFTPACK by Paul N. Swarztrauber (Version 4, 1985).
81
82 3. Subset of Boost C++ library
83    Files: src/external/boost/boost/*
84
85 Boost Software License - Version 1.0 - August 17th, 2003
86
87 Permission is hereby granted, free of charge, to any person or organization
88 obtaining a copy of the software and accompanying documentation covered by
89 this license (the "Software") to use, reproduce, display, distribute,
90 execute, and transmit the Software, and to prepare derivative works of the
91 Software, and to permit third-parties to whom the Software is furnished to
92 do so, all subject to the following:
93
94 The copyright notices in the Software and this entire statement, including
95 the above license grant, this restriction and the following disclaimer,
96 must be included in all copies of the Software, in whole or in part, and
97 all derivative works of the Software, unless such copies or derivative
98 works are solely in the form of machine-executable object code generated by
99 a source language processor.
100
101 THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
102 IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
103 FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE, TITLE AND NON-INFRINGEMENT. IN NO EVENT
104 SHALL THE COPYRIGHT HOLDERS OR ANYONE DISTRIBUTING THE SOFTWARE BE LIABLE
105 FOR ANY DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, TORT OR OTHERWISE,
106 ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER
107 DEALINGS IN THE SOFTWARE.
108
109 4. Google Test and Google Mock
110    Files: src/external/gmock-1.6.0/*
111
112 Copyright 2008, Google Inc.
113 All rights reserved.
114
115 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
116 modification, are permitted provided that the following conditions are
117 met:
118
119     * Redistributions of source code must retain the above copyright
120 notice, this list of conditions and the following disclaimer.
121     * Redistributions in binary form must reproduce the above
122 copyright notice, this list of conditions and the following disclaimer
123 in the documentation and/or other materials provided with the
124 distribution.
125     * Neither the name of Google Inc. nor the names of its
126 contributors may be used to endorse or promote products derived from
127 this software without specific prior written permission.
128
129 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
130 "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
131 LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
132 A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT
133 OWNER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
134 SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
135 LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
136 DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
137 THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
138 (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
139 OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.