fix internal/external OpenMP thread affinity clash
[alexxy/gromacs.git] / COPYING-OTHER
1 GROMACS is free software, distributed under the GNU General Public License. 
2 See COPING for details. It however includes optional code covered by several 
3 different licences as described below.
4
5
6 1. Trajectory file reading using VMD plugins 
7    Files: include/molfile_plugin.h
8           include/vmddlopen.h
9           include/vmdplugin.h
10           src/gmxlib/vmddlopen.c
11           src/gmxlib/vmdio.c
12
13                 (C) Copyright 1995-2009 The Board of Trustees of the
14                             University of Illinois
15                              All Rights Reserved
16
17 Developed by:           Theoretical and Computational Biophysics Group
18                         University of Illinois at Urbana-Champaign
19                         http://www.ks.uiuc.edu/
20
21 Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of
22 this software and associated documentation files (the Software), to deal with
23 the Software without restriction, including without limitation the rights to
24 use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell copies
25 of the Software, and to permit persons to whom the Software is furnished to
26 do so, subject to the following conditions:
27
28 Redistributions of source code must retain the above copyright notice,
29 this list of conditions and the following disclaimers.
30
31 Redistributions in binary form must reproduce the above copyright notice,
32 this list of conditions and the following disclaimers in the documentation
33 and/or other materials provided with the distribution.
34
35 Neither the names of Theoretical and Computational Biophysics Group,
36 University of Illinois at Urbana-Champaign, nor the names of its contributors
37 may be used to endorse or promote products derived from this Software without
38 specific prior written permission.
39
40 THE SOFTWARE IS PROVIDED AS IS, WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
41 IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
42 FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT.  IN NO EVENT SHALL
43 THE CONTRIBUTORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR
44 OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE,
45 ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR
46 OTHER DEALINGS WITH THE SOFTWARE.
47
48 2. Internal FFT
49    Files: src/mdlib/fftpack.c
50
51 Copyright (c) 2005-2011, NumPy Developers.
52 All rights reserved.
53
54 Redistribution and use in source and binary forms, with or without
55 modification, are permitted provided that the following conditions are
56 met:
57
58     * Redistributions of source code must retain the above copyright
59        notice, this list of conditions and the following disclaimer.
60
61     * Redistributions in binary form must reproduce the above
62        copyright notice, this list of conditions and the following
63        disclaimer in the documentation and/or other materials provided
64        with the distribution.
65
66     * Neither the name of the NumPy Developers nor the names of any
67        contributors may be used to endorse or promote products derived
68        from this software without specific prior written permission.
69
70 THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
71 "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
72 LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
73 A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED. IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT
74 OWNER OR CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL,
75 SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT
76 LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE,
77 DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY
78 THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT
79 (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE
80 OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
81
82 fftpack.c : A set of FFT routines in C.
83 Algorithmically based on Fortran-77 FFTPACK by Paul N. Swarztrauber (Version 4, 1985).